More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2847 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
277 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  47.47 
 
 
294 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
294 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
270 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
297 aa  201  7e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
275 aa  188  7e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.05 
 
 
299 aa  185  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
297 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
296 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  34.2 
 
 
297 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
297 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  35.97 
 
 
306 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
268 aa  168  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
270 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
298 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
281 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0738  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
270 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0974  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
270 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
297 aa  163  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
276 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
273 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
270 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  35.48 
 
 
292 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
295 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  35.53 
 
 
295 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.33 
 
 
273 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  34.1 
 
 
278 aa  155  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  37.56 
 
 
278 aa  155  8e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
278 aa  155  9e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  37.27 
 
 
271 aa  154  1e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  33.7 
 
 
277 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
298 aa  154  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
269 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  33.7 
 
 
277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.43 
 
 
275 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
315 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.48 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 
276 aa  152  4e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
271 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  34.52 
 
 
291 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
275 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000194486  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.3 
 
 
296 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.72 
 
 
275 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
274 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
274 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  31.5 
 
 
286 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
286 aa  150  3e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
722 aa  150  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.6 
 
 
300 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4134  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
271 aa  148  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  29.71 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.38 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0919  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.5 
 
 
246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  32.27 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04020  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.5 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32 
 
 
306 aa  146  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
275 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  35.71 
 
 
350 aa  146  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
298 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
280 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0410  Monosaccharide-transporting ATPase  32.18 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.74 
 
 
275 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.06 
 
 
295 aa  144  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
284 aa  144  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
281 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
284 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
279 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  30.82 
 
 
278 aa  143  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  33.59 
 
 
272 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
297 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
272 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  32.71 
 
 
277 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
293 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
282 aa  142  4e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
294 aa  142  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
301 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
270 aa  142  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.143888  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  33.63 
 
 
308 aa  142  5e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3392  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.04 
 
 
278 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196448  normal  0.954202 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.58 
 
 
271 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
278 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.97 
 
 
275 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
290 aa  142  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.45 
 
 
301 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.86 
 
 
303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  32.77 
 
 
701 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>