More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1787 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.22 
 
 
298 aa  324  1e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.78 
 
 
279 aa  316  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  53.85 
 
 
273 aa  296  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  52.73 
 
 
283 aa  288  5.0000000000000004e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.23 
 
 
297 aa  285  8e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.18 
 
 
302 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  52 
 
 
304 aa  278  8e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.76 
 
 
298 aa  276  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  51.55 
 
 
304 aa  259  4e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.6 
 
 
298 aa  256  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
303 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.14 
 
 
277 aa  242  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.49 
 
 
261 aa  240  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.94 
 
 
280 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.81 
 
 
280 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  51.94 
 
 
297 aa  230  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  45.93 
 
 
291 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
275 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 
297 aa  223  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.43 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
306 aa  218  1e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
268 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
296 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
297 aa  192  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  40.07 
 
 
297 aa  191  9e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  37.36 
 
 
278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.34 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.08 
 
 
299 aa  186  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
275 aa  185  7e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
294 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  40.79 
 
 
306 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  38.34 
 
 
278 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
295 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
269 aa  178  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.42 
 
 
274 aa  176  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
270 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
278 aa  172  5.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  37.3 
 
 
277 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  37.3 
 
 
277 aa  170  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.4 
 
 
279 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
283 aa  167  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
284 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
275 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.53 
 
 
294 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  36.78 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
246 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
275 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.22 
 
 
279 aa  161  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
294 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  36.13 
 
 
286 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
275 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
281 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
271 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
277 aa  160  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
274 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.8 
 
 
271 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
283 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
275 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
278 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
271 aa  159  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.06 
 
 
390 aa  159  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.97 
 
 
278 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
274 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
278 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.96 
 
 
277 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
278 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.43 
 
 
275 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  37.64 
 
 
295 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.73 
 
 
295 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  34.48 
 
 
294 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
277 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.94 
 
 
302 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  34.46 
 
 
278 aa  155  8e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
300 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  34.46 
 
 
278 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
279 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  35.02 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  40.78 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
290 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  39.81 
 
 
278 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
299 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.09 
 
 
296 aa  151  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5362  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
352 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273783  normal  0.517173 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5763  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.44 
 
 
350 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411796  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  34.9 
 
 
271 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  41.88 
 
 
263 aa  150  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
276 aa  150  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
304 aa  150  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.44 
 
 
281 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
310 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
279 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>