More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
302 aa  593  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.2 
 
 
311 aa  422  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.19 
 
 
298 aa  364  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  65.6 
 
 
290 aa  345  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
273 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  43.82 
 
 
277 aa  226  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.62 
 
 
299 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.27 
 
 
281 aa  225  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.26 
 
 
299 aa  225  7e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  43.53 
 
 
278 aa  225  7e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.89 
 
 
299 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  43.2 
 
 
278 aa  218  7e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  42.34 
 
 
269 aa  216  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.33 
 
 
295 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
275 aa  211  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  40.82 
 
 
277 aa  210  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
297 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  41.5 
 
 
297 aa  210  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  40.82 
 
 
277 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
284 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
275 aa  208  1e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
297 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
310 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
306 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  43.53 
 
 
278 aa  207  2e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  43.53 
 
 
278 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.35 
 
 
270 aa  206  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.4 
 
 
270 aa  205  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
301 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
273 aa  204  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
294 aa  204  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
279 aa  204  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.02 
 
 
324 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  42.26 
 
 
271 aa  203  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.71 
 
 
300 aa  202  4e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.19 
 
 
305 aa  203  4e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
275 aa  203  4e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  41.03 
 
 
281 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  40.94 
 
 
292 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.8 
 
 
298 aa  202  6e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  41.6 
 
 
275 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.85 
 
 
277 aa  201  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  40.73 
 
 
276 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  39.35 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
277 aa  199  5e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
274 aa  199  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
278 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.21 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.98 
 
 
246 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3122  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.290341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
315 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
292 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  37.5 
 
 
306 aa  195  7e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
278 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
297 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
290 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
296 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
280 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.54 
 
 
309 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
299 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
286 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.69 
 
 
301 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
296 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
295 aa  192  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  40.44 
 
 
272 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.83 
 
 
304 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.52 
 
 
295 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.44 
 
 
272 aa  192  7e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  40.24 
 
 
271 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
275 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.24 
 
 
271 aa  191  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  36.4 
 
 
286 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.48 
 
 
291 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
278 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
299 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.82 
 
 
275 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.13 
 
 
312 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.83 
 
 
268 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  37.36 
 
 
278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
290 aa  190  2.9999999999999997e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.66 
 
 
306 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
305 aa  189  4e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35 
 
 
307 aa  189  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
308 aa  189  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
300 aa  188  7e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
298 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
294 aa  188  9e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
278 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0175  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.02 
 
 
278 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
268 aa  187  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 
275 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
285 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
291 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>