More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5461 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
279 aa  558  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.89 
 
 
298 aa  325  7e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7171  sugar transport system (permease)  58.03 
 
 
283 aa  317  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0389176 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0840  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  57.25 
 
 
273 aa  315  7e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.610279  normal  0.112445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.58 
 
 
297 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1787  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.78 
 
 
272 aa  298  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.218781  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.55 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00177289  normal  0.959368 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.82 
 
 
277 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1559  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.93 
 
 
280 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.611618 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1508  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
280 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000891733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0936  multiple sugar transport system permease protein  50 
 
 
304 aa  271  6e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.615201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3306  sugar transport system (permease)  52.03 
 
 
291 aa  266  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 
261 aa  256  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.290821  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1893  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  52.57 
 
 
297 aa  256  4e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.09 
 
 
284 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
298 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.35 
 
 
297 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.43 
 
 
302 aa  235  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698464 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.38 
 
 
275 aa  232  5e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  45.96 
 
 
304 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1880  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
306 aa  219  3.9999999999999997e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.228112  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.72 
 
 
303 aa  219  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.88 
 
 
306 aa  203  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
297 aa  202  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
268 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0552972  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0164382  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
276 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
275 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  39.04 
 
 
278 aa  188  9e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19300  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.23 
 
 
299 aa  186  4e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  37.88 
 
 
297 aa  185  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
297 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  36.4 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
294 aa  183  3e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68182  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
278 aa  180  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
295 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
283 aa  178  8e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
246 aa  177  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
270 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
269 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
279 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000702238  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
271 aa  175  8e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
274 aa  175  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  36.89 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
273 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  36.89 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  39.92 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.39 
 
 
281 aa  172  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3639  monosaccharide-transporting ATPase  37.41 
 
 
292 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.16 
 
 
279 aa  171  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
271 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  37.13 
 
 
271 aa  169  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
271 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.55 
 
 
271 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
281 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
324 aa  166  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.41 
 
 
295 aa  166  4e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  36.64 
 
 
306 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  37.25 
 
 
278 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  37.25 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  36.97 
 
 
276 aa  165  8e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
275 aa  165  8e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06939  hypothetical protein  33.72 
 
 
294 aa  165  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.77 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2847  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.525559  normal  0.0514603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
275 aa  163  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  39.22 
 
 
287 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
270 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
279 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
310 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
295 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
283 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  37.31 
 
 
273 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
294 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.91 
 
 
284 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
275 aa  159  6e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.58 
 
 
271 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
275 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
285 aa  157  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
274 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  38.36 
 
 
263 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2838  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
276 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.314351 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.48 
 
 
277 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.61 
 
 
302 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
291 aa  155  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.62 
 
 
282 aa  155  8e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
300 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  33.89 
 
 
277 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
311 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
300 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  36.36 
 
 
286 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
295 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
301 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  33.2 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
390 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>