More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3574 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
290 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  63.3 
 
 
302 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.25 
 
 
311 aa  354  1e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.7 
 
 
298 aa  316  3e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  45.88 
 
 
278 aa  251  9.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  45.52 
 
 
278 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  46.39 
 
 
277 aa  250  2e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.63 
 
 
273 aa  242  6e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
270 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  44.19 
 
 
269 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.8 
 
 
294 aa  235  7e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.25 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.45 
 
 
275 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.21 
 
 
281 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.3 
 
 
290 aa  232  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  44.71 
 
 
278 aa  232  7.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  44.71 
 
 
278 aa  231  8.000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.43 
 
 
295 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
284 aa  228  7e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.74 
 
 
299 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
310 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.39 
 
 
271 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  39.35 
 
 
277 aa  223  4e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.41 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.42 
 
 
299 aa  218  6e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  38.63 
 
 
277 aa  218  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  42.19 
 
 
276 aa  217  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
290 aa  216  4e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.18 
 
 
301 aa  216  4e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
295 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1924  sugar ABC transporter, permease protein  43.73 
 
 
271 aa  215  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.444482  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.2 
 
 
298 aa  215  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
280 aa  214  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.72 
 
 
246 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
301 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
283 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
288 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.86 
 
 
281 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2894  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
297 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
299 aa  211  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1881  monosaccharide-transporting ATPase  42.42 
 
 
297 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
274 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
295 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  38.87 
 
 
277 aa  209  4e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
275 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
290 aa  209  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309927  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.77 
 
 
279 aa  209  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
268 aa  209  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
273 aa  208  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2040  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.13 
 
 
305 aa  208  7e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00998336  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  42.59 
 
 
272 aa  208  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.59 
 
 
272 aa  208  7e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
300 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.48 
 
 
297 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  37.63 
 
 
308 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
315 aa  207  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
279 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
289 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04290  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
297 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  39.3 
 
 
275 aa  206  4e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.53 
 
 
306 aa  206  5e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3955  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
274 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  42.97 
 
 
273 aa  205  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 
306 aa  205  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
278 aa  205  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
290 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.4 
 
 
291 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
295 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.97 
 
 
297 aa  203  2e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
286 aa  203  3e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2864  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
278 aa  203  3e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40 
 
 
296 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
268 aa  201  8e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146401  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
280 aa  201  9e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3150  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
278 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.198934  normal  0.328694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  37.67 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.93 
 
 
296 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.31 
 
 
287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
279 aa  200  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
301 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1217  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
275 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000178765  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 
299 aa  200  3e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.56 
 
 
285 aa  199  6e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.18 
 
 
300 aa  199  6e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0827234 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  42 
 
 
280 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0130  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.24 
 
 
278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.519096  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  39.04 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.091777  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.8 
 
 
275 aa  196  3e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3224  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
283 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.37 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  36.02 
 
 
276 aa  195  6e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>