More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1082 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
304 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1189  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  91.78 
 
 
304 aa  521  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.535911  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.01 
 
 
283 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5004  sugar ABC transporter permease  75.54 
 
 
316 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0638088  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  63.54 
 
 
305 aa  362  4e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.41 
 
 
291 aa  360  1e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.378357  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.34 
 
 
314 aa  329  4e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.023503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10970  carbohydrate ABC transporter membrane protein  55.83 
 
 
314 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0194  MalG-type ABC sugar transport system permease component  46.96 
 
 
285 aa  249  4e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.33 
 
 
279 aa  206  3e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  37.01 
 
 
281 aa  204  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  40.24 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  37.64 
 
 
277 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09191  ABC-type sugar transport system, permease component  39.18 
 
 
287 aa  195  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.104594 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0728  putative permease protein of sugar ABC transporter  40.82 
 
 
263 aa  194  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  38.85 
 
 
277 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
271 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.85 
 
 
271 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
282 aa  192  7e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1938  putative permease protein of sugar ABC transporter  39.84 
 
 
274 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
271 aa  186  6e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
271 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
299 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  36.74 
 
 
277 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
295 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
303 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.99 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.63 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0286  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
302 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
294 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  36.11 
 
 
280 aa  170  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  35.27 
 
 
278 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
275 aa  169  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
299 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
272 aa  168  8e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
301 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.45 
 
 
291 aa  167  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
302 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
300 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  31.82 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
280 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  35.46 
 
 
278 aa  163  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  31.87 
 
 
269 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  31.44 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
311 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.73 
 
 
300 aa  162  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
299 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
273 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
269 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
278 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
280 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
301 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
275 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  33.96 
 
 
278 aa  159  7e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
289 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
293 aa  157  1e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000740706  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
278 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
246 aa  157  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
276 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  156  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
298 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.97 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  32.89 
 
 
293 aa  155  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12849  sn-glycerol-3-phosphate transport integral membrane protein ABC transporter ugpE  35.34 
 
 
275 aa  155  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144305  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  31.65 
 
 
306 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
276 aa  155  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
281 aa  155  9e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
291 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
301 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.74 
 
 
275 aa  154  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2167  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
295 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
297 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0358856  normal  0.0688869 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
280 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
291 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
296 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000371485  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
301 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
279 aa  152  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
279 aa  152  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.16 
 
 
295 aa  152  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.36 
 
 
297 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.22 
 
 
297 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.37 
 
 
302 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
284 aa  150  2e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  34.6 
 
 
278 aa  151  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
315 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
275 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
284 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  34.38 
 
 
278 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>