More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1531 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
275 aa  556  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
284 aa  216  2e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
281 aa  212  7e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
288 aa  206  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
281 aa  191  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
283 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
294 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
284 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
294 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
282 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
282 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.67 
 
 
279 aa  177  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
278 aa  176  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  36.33 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
303 aa  172  7.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.31 
 
 
288 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
281 aa  170  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
298 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  33.08 
 
 
281 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
303 aa  169  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
282 aa  168  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 
293 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  35.06 
 
 
293 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
314 aa  166  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
279 aa  166  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3987  putative sugar ABC transporter (permease protein)  35.11 
 
 
282 aa  166  4e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  35.96 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
276 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
299 aa  163  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
275 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
306 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
279 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
276 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
293 aa  159  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.64 
 
 
312 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  32.14 
 
 
303 aa  159  4e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
282 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
275 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
283 aa  159  6e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
293 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
284 aa  158  1e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
319 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.17 
 
 
278 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
271 aa  155  6e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
294 aa  155  6e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.71 
 
 
301 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
295 aa  155  8e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
296 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
291 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
281 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  32.03 
 
 
303 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
319 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
278 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
298 aa  153  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
275 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
282 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2048  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
268 aa  152  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.353997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
279 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
283 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
283 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
298 aa  150  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
297 aa  149  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.807172 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
275 aa  149  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
275 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
302 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505045  normal  0.0752536 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.42 
 
 
277 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
271 aa  149  7e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.35 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
284 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.12 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  31.97 
 
 
292 aa  146  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.11 
 
 
283 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
281 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
273 aa  146  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
299 aa  145  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
301 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.25 
 
 
297 aa  145  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
298 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
279 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 
275 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
278 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  32.04 
 
 
306 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1220  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
276 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
273 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.7 
 
 
282 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.1 
 
 
293 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27720  ABC-type sugar transport system, permease component  32.23 
 
 
284 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333543  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
279 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>