More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2308 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.09 
 
 
277 aa  276  3e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.81 
 
 
275 aa  272  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
283 aa  232  6e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
278 aa  227  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
278 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.94 
 
 
279 aa  226  4e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
281 aa  223  3e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
282 aa  218  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
273 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.75 
 
 
275 aa  209  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.54 
 
 
276 aa  208  8e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
299 aa  208  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.08 
 
 
275 aa  207  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  40.6 
 
 
280 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.55 
 
 
276 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.01 
 
 
281 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
278 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.62 
 
 
280 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
277 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  40.23 
 
 
280 aa  202  4e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.35 
 
 
282 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
279 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  40.15 
 
 
295 aa  192  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
298 aa  192  5e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.93 
 
 
278 aa  192  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
288 aa  191  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.19 
 
 
298 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
278 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.58 
 
 
278 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.96 
 
 
273 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
280 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
276 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
275 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  38.52 
 
 
275 aa  188  7e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.69 
 
 
313 aa  188  7e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409938  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
284 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.1 
 
 
298 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
286 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
277 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
272 aa  186  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
280 aa  186  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
277 aa  186  3e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.26 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11262  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugB  40.62 
 
 
274 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.32 
 
 
289 aa  181  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
291 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3984100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
277 aa  178  7e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
285 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
292 aa  178  8e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.445244 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
277 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 
280 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.71 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.36 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.345018 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
267 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.071417  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
284 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
276 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
275 aa  170  3e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
283 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.32 
 
 
297 aa  168  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
279 aa  167  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
276 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.173525 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
283 aa  166  4e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
277 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
292 aa  165  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2266  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
330 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.337331  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
278 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
288 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  32.71 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.489917  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
274 aa  161  9e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  161  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
271 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.34 
 
 
275 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.78 
 
 
274 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.41 
 
 
276 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.85 
 
 
278 aa  159  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
273 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
289 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.89 
 
 
283 aa  159  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.01 
 
 
275 aa  158  9e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
276 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  33.09 
 
 
283 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6239  ABC transporter membrane spanning protein (maltose)  36.12 
 
 
286 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
313 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  33.72 
 
 
279 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
286 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
288 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
279 aa  157  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
273 aa  156  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  31.18 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>