More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2624 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  555  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.21 
 
 
284 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2295  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.31 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.939147  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.03 
 
 
293 aa  217  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
281 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83959  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.68 
 
 
285 aa  209  4e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
277 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
275 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.81 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.16 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.81 
 
 
283 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  36.69 
 
 
291 aa  195  8.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.79 
 
 
277 aa  195  9e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
283 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
281 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 
281 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
279 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
298 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.63 
 
 
289 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
283 aa  185  7e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.62 
 
 
278 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
282 aa  182  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
279 aa  181  1e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
278 aa  180  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
285 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.547781 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.72 
 
 
277 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
288 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
287 aa  176  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
281 aa  175  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37 
 
 
275 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
284 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065043  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.18 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
276 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0173  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
311 aa  170  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
285 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.397277  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  34.52 
 
 
280 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
271 aa  169  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 
283 aa  169  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
276 aa  168  7e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
274 aa  168  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  39.34 
 
 
275 aa  168  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.31 
 
 
280 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
292 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.445244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
286 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
284 aa  167  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 
283 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.13 
 
 
275 aa  167  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  38.25 
 
 
275 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
280 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 
280 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.75 
 
 
297 aa  166  4e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  37.55 
 
 
295 aa  166  4e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
276 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
275 aa  165  9e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
275 aa  165  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
281 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.5 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4145  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.3 
 
 
293 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
275 aa  163  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
280 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
295 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
277 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
280 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
289 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
278 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
278 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
278 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
293 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
273 aa  161  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
277 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
281 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.965906  normal  0.767737 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
299 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0255144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
277 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
274 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.45 
 
 
295 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0418  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.75 
 
 
283 aa  159  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  33.06 
 
 
279 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  33.33 
 
 
286 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
277 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
311 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
296 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
299 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
298 aa  158  9e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>