More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7705 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  100 
 
 
301 aa  613  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  69.96 
 
 
292 aa  391  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  63.38 
 
 
303 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.37 
 
 
319 aa  311  6.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.19 
 
 
319 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.4 
 
 
314 aa  308  6.999999999999999e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.79 
 
 
303 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  47.3 
 
 
303 aa  293  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.18 
 
 
298 aa  277  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
285 aa  207  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
293 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
276 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
281 aa  179  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  32.08 
 
 
293 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  32.08 
 
 
293 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2104  permease protein  31.69 
 
 
329 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.377288  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
288 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  36.12 
 
 
281 aa  175  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
275 aa  175  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.08 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
284 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
284 aa  171  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
280 aa  169  5e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
298 aa  168  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
287 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
281 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.36 
 
 
281 aa  165  9e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0981879  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.63 
 
 
303 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
292 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2764  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
275 aa  160  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
296 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
294 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
277 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3987  putative sugar ABC transporter (permease protein)  32.46 
 
 
282 aa  159  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3249  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.14 
 
 
284 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
282 aa  157  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 
291 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
294 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.46 
 
 
278 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
297 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.88 
 
 
291 aa  157  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
279 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
278 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
273 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.65 
 
 
283 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2756  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
297 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
297 aa  155  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
275 aa  154  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.47 
 
 
284 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.78 
 
 
288 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
279 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2948  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
282 aa  152  8.999999999999999e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  30.82 
 
 
277 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
297 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27720  ABC-type sugar transport system, permease component  33.79 
 
 
284 aa  151  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333543  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6935  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.94 
 
 
300 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  32.53 
 
 
285 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
280 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
282 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.766168 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
297 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.04 
 
 
279 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
283 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
279 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
298 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
277 aa  150  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.03 
 
 
279 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.26 
 
 
274 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
289 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
299 aa  149  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1687  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.21 
 
 
282 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.437147  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  30.92 
 
 
276 aa  149  7e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.89 
 
 
275 aa  149  7e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
274 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
278 aa  148  9e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
278 aa  148  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 
277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0519  sugar ABC transporter, permease protein  30.39 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
281 aa  147  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0452  sugar ABC transporter, permease protein  30.1 
 
 
279 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
288 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
279 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
284 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
292 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3548  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.97 
 
 
279 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
299 aa  146  5e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  31.44 
 
 
271 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.85 
 
 
279 aa  145  6e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.65 
 
 
275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.28 
 
 
303 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.17 
 
 
291 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>