More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2714 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
284 aa  246  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
281 aa  225  6e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
275 aa  206  2e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
285 aa  202  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
279 aa  189  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
294 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
279 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
275 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
294 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.2 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  35.52 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  35.17 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
276 aa  172  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.776984  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.57 
 
 
279 aa  171  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
283 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
275 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
277 aa  168  8e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
296 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
276 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
281 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
281 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.31 
 
 
299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
278 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.21 
 
 
278 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.72 
 
 
291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3984100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  33.85 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
276 aa  162  7e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.11 
 
 
281 aa  162  9e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  33.91 
 
 
301 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  32.82 
 
 
279 aa  161  1e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
283 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.92 
 
 
275 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
277 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
278 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
283 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
281 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
273 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
285 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  33.71 
 
 
271 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
316 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
303 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.02 
 
 
276 aa  157  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.47 
 
 
284 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  32.58 
 
 
285 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
299 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.66 
 
 
305 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
281 aa  155  8e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.08 
 
 
295 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
275 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.4 
 
 
273 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  30.48 
 
 
293 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
273 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  32.61 
 
 
303 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.92 
 
 
274 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.56 
 
 
295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
271 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.34 
 
 
293 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
293 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
277 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
291 aa  152  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.03 
 
 
283 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.49 
 
 
303 aa  152  7e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.83 
 
 
275 aa  152  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
287 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  0.0256489 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.19 
 
 
280 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
304 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.56 
 
 
319 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.16 
 
 
278 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
279 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169914  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
304 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  32.17 
 
 
303 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
281 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.27 
 
 
283 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
277 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
279 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.239478  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
282 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0061  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.43 
 
 
297 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  32.61 
 
 
275 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.7 
 
 
279 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
277 aa  149  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
273 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
299 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.73 
 
 
278 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3155  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
279 aa  148  8e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.25 
 
 
275 aa  148  9e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
279 aa  148  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0154166  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.04 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
277 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>