More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1542 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.239875  normal  0.0256489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3943  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.38 
 
 
310 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.7 
 
 
285 aa  182  6e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  37.37 
 
 
293 aa  181  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
274 aa  179  4e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
301 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
291 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0974901  normal  0.381629 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  38.19 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
288 aa  171  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
295 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.925961 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.26 
 
 
312 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
296 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
275 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
273 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.54 
 
 
294 aa  168  7e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
275 aa  169  7e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0497  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
306 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  39.85 
 
 
273 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
286 aa  166  4e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0123708 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3073  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
315 aa  165  8e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1703  putative transport system permease ABC transporter protein  35.38 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.757038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.924355  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4346  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
292 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000934569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.23 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.942295  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.1 
 
 
275 aa  162  7e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
299 aa  162  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2536  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
306 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.250656  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
299 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
294 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
299 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.06 
 
 
301 aa  160  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.51 
 
 
307 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
273 aa  159  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0921  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.35 
 
 
284 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
297 aa  158  8e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
295 aa  158  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
283 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
275 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  34.98 
 
 
276 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
281 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.17 
 
 
297 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.807172 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1314  ABC transporter, permease protein  34.73 
 
 
273 aa  156  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
298 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.86 
 
 
297 aa  156  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
300 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
275 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.74 
 
 
305 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  33.2 
 
 
277 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.85 
 
 
297 aa  154  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
283 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
273 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.85 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
308 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.013285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
300 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  32.79 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
298 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
284 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
285 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
275 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.1 
 
 
319 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.05 
 
 
278 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
292 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
309 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
298 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.44 
 
 
279 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
311 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.08 
 
 
302 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
283 aa  150  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.372936  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  34.01 
 
 
292 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
319 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.93 
 
 
275 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
293 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
296 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
283 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.2 
 
 
280 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
277 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
301 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.06 
 
 
303 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
284 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1058  MalG-type ABC sugar transport system permease component  36.79 
 
 
277 aa  149  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6549  sugar ABC transporter, permease protein  34.17 
 
 
299 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000581927 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
293 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
300 aa  148  9e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.18 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0224694  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.4 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.74 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
275 aa  146  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>