More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1707 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1707  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
303 aa  603  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.384192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2253  sugar ABC transporter (permease)  51.91 
 
 
281 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.273878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.24 
 
 
302 aa  261  1e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.505045  normal  0.0752536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.04 
 
 
315 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266328 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0558  ABC transporter, permease protein  35.25 
 
 
293 aa  175  9e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0542  transmembrane transport protein  34.87 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1939  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
314 aa  170  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0503026  normal  0.979613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1531  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
275 aa  169  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3994  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
303 aa  166  5e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23830  ABC-type sugar transport system, permease component  34.93 
 
 
303 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1668  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.2 
 
 
284 aa  165  8e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.771633  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.55 
 
 
285 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2049  sugar ABC transporter (permease)  36.16 
 
 
303 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.907779  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
288 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2104  permease protein  31.44 
 
 
329 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.377288  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.45 
 
 
292 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5530  sugar ABC transporter (permease)  35.37 
 
 
292 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.30156 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
294 aa  152  5.9999999999999996e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1945  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.6 
 
 
271 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232263  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27720  ABC-type sugar transport system, permease component  35.76 
 
 
284 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.333543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7705  sugar ABC transporter (permease)  31.63 
 
 
301 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.8 
 
 
284 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.22 
 
 
294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
319 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.450418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2857  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
298 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.705306  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
294 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0202  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.44 
 
 
284 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
293 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1617  putative binding-protein-dependent transport protein  30.93 
 
 
304 aa  138  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.201797  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.65 
 
 
281 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0294  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.8 
 
 
278 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
279 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
288 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.94 
 
 
296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
277 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6935  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.14 
 
 
300 aa  136  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111402  normal  0.938789 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
290 aa  135  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000548355  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
277 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3677  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
304 aa  134  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.842824 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.18 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.49 
 
 
283 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8234  maltose transport protein  30.69 
 
 
271 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367769  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.38 
 
 
283 aa  133  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.88 
 
 
281 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0384109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3817  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.07 
 
 
283 aa  133  3.9999999999999996e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.76 
 
 
288 aa  132  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.86 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.57 
 
 
294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.454019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.67 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.91 
 
 
298 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3943  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  31.23 
 
 
281 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0114669  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
297 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.61 
 
 
304 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  129  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
279 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6574  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.315492  normal  0.863865 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.16 
 
 
280 aa  128  9.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183676  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.81 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000333491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.98 
 
 
283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.56 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.29 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1117  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.98 
 
 
275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.43 
 
 
299 aa  127  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
276 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  normal  0.856041 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5400  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  31.95 
 
 
275 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.853181  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
283 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2694  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
279 aa  125  8.000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  31.25 
 
 
286 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
271 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
278 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
278 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.26 
 
 
271 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  0.0825161 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.63 
 
 
282 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  33.46 
 
 
275 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.72 
 
 
275 aa  123  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  33.46 
 
 
275 aa  123  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1115  sugar ABC transporter, permease protein  29.08 
 
 
285 aa  122  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0469179  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
287 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.89 
 
 
271 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0761213  normal  0.695628 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
291 aa  122  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  29.18 
 
 
291 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0067  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.72 
 
 
295 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
296 aa  122  9e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.27 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.370604  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1027  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
279 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.006727  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.101214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
288 aa  122  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00860  ABC-type sugar transport system, permease component  34.62 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>