More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4402 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  81.14 
 
 
298 aa  464  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.36 
 
 
271 aa  250  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
255 aa  242  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  40.89 
 
 
274 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
269 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.489917  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
271 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  0.0825161 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
271 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0761213  normal  0.695628 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4035  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.5 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.75 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  37.75 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  37.75 
 
 
275 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
272 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  36.68 
 
 
272 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
278 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
274 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
285 aa  175  8e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  35.66 
 
 
275 aa  172  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
288 aa  172  7.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.82 
 
 
285 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
274 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
306 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
275 aa  168  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
316 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3227  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.27 
 
 
285 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0108394  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.72 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
275 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
305 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.87 
 
 
278 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
286 aa  165  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.98 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
299 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
276 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.68 
 
 
283 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
296 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.41 
 
 
282 aa  162  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
278 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.16 
 
 
282 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.46 
 
 
283 aa  160  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.12 
 
 
298 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
278 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
296 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
275 aa  159  4e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
305 aa  159  4e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
283 aa  159  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
295 aa  159  6e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
287 aa  158  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.49 
 
 
316 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
283 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
286 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.96 
 
 
279 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
277 aa  156  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
277 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
297 aa  155  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.11 
 
 
276 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
288 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
281 aa  155  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.51 
 
 
297 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
273 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
277 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
279 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.38 
 
 
292 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
289 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
273 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.14 
 
 
316 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.18 
 
 
284 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
290 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
322 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
307 aa  149  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
293 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
276 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.194012 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
288 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
276 aa  148  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.43 
 
 
279 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  35.36 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  34.86 
 
 
280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188981  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
291 aa  147  3e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
277 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
291 aa  147  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2678  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.55 
 
 
289 aa  146  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
292 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
303 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265009  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
283 aa  146  4.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
275 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
279 aa  145  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
275 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
286 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3777  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.4 
 
 
271 aa  145  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  0.498106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.05565  normal  0.793563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5924  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.23 
 
 
283 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755029  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
275 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>