More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0415 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
298 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.92 
 
 
298 aa  530  1e-149  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.14 
 
 
313 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0409938  normal  0.173322 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.83 
 
 
298 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
275 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.75 
 
 
275 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.47 
 
 
277 aa  240  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  46.18 
 
 
282 aa  238  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 
277 aa  235  7e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.1 
 
 
299 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.28 
 
 
281 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3995  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.26 
 
 
278 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273063  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 
277 aa  231  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04600  ABC-type sugar transport system, permease component  44.03 
 
 
295 aa  231  9e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.539803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.95 
 
 
273 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
278 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.91 
 
 
278 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.898469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1115  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.88 
 
 
280 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.565272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.18 
 
 
280 aa  226  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  42.25 
 
 
280 aa  225  8e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11262  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter sugB  44.96 
 
 
274 aa  223  4e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203297 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.91 
 
 
279 aa  223  4e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.12 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.56 
 
 
295 aa  219  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
277 aa  220  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.26 
 
 
282 aa  219  5e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
276 aa  218  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.71 
 
 
273 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
283 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.33 
 
 
284 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  48.9 
 
 
289 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  43.22 
 
 
275 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
275 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.76 
 
 
286 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
292 aa  192  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.445244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.46 
 
 
280 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2308  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000390677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  39.69 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
283 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.345018 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.74 
 
 
299 aa  185  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.78 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
280 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
288 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
277 aa  181  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
283 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
278 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 
281 aa  174  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
276 aa  172  7.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
276 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.173525 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.03 
 
 
283 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 
291 aa  168  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3984100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1329  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
279 aa  167  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
283 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  35.42 
 
 
291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13120  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.28 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.56 
 
 
277 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
299 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0948  permease protein of sugar ABC transporter  37.64 
 
 
275 aa  160  3e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.845711  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.58 
 
 
271 aa  160  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
278 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
292 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
280 aa  159  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
285 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
276 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
274 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.69 
 
 
283 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
277 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.46 
 
 
293 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  35.21 
 
 
278 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
267 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.071417  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
288 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
277 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
277 aa  153  4e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
286 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
255 aa  152  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
279 aa  151  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2457  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
275 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.741227  normal  0.869108 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
288 aa  150  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
272 aa  149  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
283 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
277 aa  149  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
316 aa  149  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
281 aa  149  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
285 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
287 aa  148  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  32.94 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
278 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.59 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
293 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  0.943286 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.98 
 
 
296 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>