More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2818 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
255 aa  500  1e-140  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.78 
 
 
271 aa  279  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  47.81 
 
 
298 aa  248  6e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.67 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  45.75 
 
 
274 aa  227  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.56 
 
 
271 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0761213  normal  0.695628 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
271 aa  218  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  0.0825161 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.53 
 
 
269 aa  210  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.489917  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0363  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.62 
 
 
272 aa  206  2e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.293535  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4035  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  42.51 
 
 
270 aa  206  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  40.39 
 
 
272 aa  200  9.999999999999999e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.86 
 
 
274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
288 aa  195  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
274 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.44 
 
 
285 aa  192  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.84 
 
 
316 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
275 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
286 aa  186  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
316 aa  185  5e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 
286 aa  185  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
305 aa  185  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
273 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  36.61 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
278 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  36.61 
 
 
275 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
275 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
277 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.05 
 
 
284 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.17 
 
 
279 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.57 
 
 
277 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
277 aa  172  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.296556  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
277 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
291 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3984100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3227  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.3 
 
 
285 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0108394  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.25 
 
 
295 aa  171  9e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
291 aa  171  2e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  33.6 
 
 
277 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.6 
 
 
277 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.96 
 
 
291 aa  171  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
276 aa  170  2e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
284 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
278 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
275 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
286 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
275 aa  168  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.83 
 
 
289 aa  168  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.46 
 
 
283 aa  168  8e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.49 
 
 
277 aa  168  8e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
278 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.86 
 
 
278 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  34.25 
 
 
277 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  33.86 
 
 
277 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.31 
 
 
282 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  40.84 
 
 
275 aa  166  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
275 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
292 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.55 
 
 
285 aa  166  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.14 
 
 
276 aa  166  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269935  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.39 
 
 
299 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 
296 aa  166  5e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
273 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.468113  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.46 
 
 
282 aa  165  6.9999999999999995e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
279 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.51 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
283 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114445  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.3 
 
 
280 aa  163  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.08 
 
 
286 aa  163  3e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
280 aa  163  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
278 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
277 aa  162  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
283 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0200189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.1 
 
 
276 aa  161  8.000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
277 aa  161  8.000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
277 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
288 aa  161  9e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180177  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
277 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.72 
 
 
277 aa  160  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
283 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.776263  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  34.63 
 
 
275 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
288 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.45 
 
 
280 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5924  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.46 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755029  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0697  mannitol ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 
285 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
281 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644522  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
283 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.31 
 
 
281 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.062126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
283 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
272 aa  159  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.598675  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1037  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.39 
 
 
288 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>