More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3058 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
286 aa  555  1e-157  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  61.78 
 
 
272 aa  338  5e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.21 
 
 
273 aa  238  9e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.468113  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.77 
 
 
278 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
271 aa  207  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
289 aa  203  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
274 aa  199  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
288 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
255 aa  197  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42 
 
 
280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  40.93 
 
 
275 aa  191  9e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
275 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  40.54 
 
 
275 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
284 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1177  ABC transporter permease  41.47 
 
 
274 aa  190  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800184  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
277 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.4 
 
 
276 aa  187  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
289 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
289 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
289 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
286 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
273 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
282 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  36.76 
 
 
277 aa  185  9e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.11 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1075  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1234  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.139462  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0067  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.864372  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0352  putative sugar ABC transporter, permease protein  39.92 
 
 
270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.5283  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.8 
 
 
274 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  37.97 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  38.35 
 
 
277 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
277 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  37.87 
 
 
277 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
293 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3067  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.46 
 
 
279 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533194  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
270 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.6 
 
 
276 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269935  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.8 
 
 
277 aa  177  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1652  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.31 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.669476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1741  ABC transporter permease protein  40.31 
 
 
270 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.592636  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5062  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
273 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5798  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
273 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0787233  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
277 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.09 
 
 
275 aa  176  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0232  putative ABC transporter permease protein  39.92 
 
 
270 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  40.52 
 
 
280 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.87 
 
 
298 aa  175  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
288 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.42 
 
 
276 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.24 
 
 
273 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.28 
 
 
297 aa  172  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
273 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
276 aa  171  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.194012 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
291 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 
283 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
291 aa  171  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
306 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.402827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
316 aa  171  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1741  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
281 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
305 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  34.58 
 
 
306 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.13 
 
 
253 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
274 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
295 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
285 aa  169  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
272 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.598675  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3582  hypothetical protein  34.85 
 
 
278 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.928396  normal  0.804079 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
292 aa  169  7e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
296 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  36.4 
 
 
275 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
273 aa  167  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.9 
 
 
285 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.32 
 
 
275 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
299 aa  168  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
275 aa  168  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.72 
 
 
302 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.46242  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
319 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
265 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2206  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.91 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91702  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4101  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  0.65761 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.77 
 
 
282 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
277 aa  166  5e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.296556  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
294 aa  165  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.96233  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3049  transmembrane ABC transporter protein  33.57 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0698875 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>