More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3227 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3227  putative sugar ABC transporter, permease protein  100 
 
 
285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0108394  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  78.25 
 
 
285 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.73 
 
 
285 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.02 
 
 
285 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.25 
 
 
279 aa  290  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.08 
 
 
288 aa  277  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.73 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.32 
 
 
288 aa  209  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.390535  normal  0.378627 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.3 
 
 
255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
292 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152491  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
292 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
292 aa  182  7e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
294 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
286 aa  179  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  37.18 
 
 
272 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.27 
 
 
288 aa  176  4e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.36 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
284 aa  169  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  36.43 
 
 
275 aa  169  6e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  36.06 
 
 
275 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 
275 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  36.63 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  37 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
286 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  34.64 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.62 
 
 
277 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
277 aa  162  6e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
275 aa  161  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
316 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1989  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.02 
 
 
284 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.951557  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
317 aa  159  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
276 aa  158  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
276 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.04 
 
 
317 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
293 aa  155  6e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
292 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
275 aa  154  1e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
273 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.59 
 
 
317 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
291 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
277 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.296556  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.98 
 
 
276 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269935  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.59 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  31.9 
 
 
291 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
269 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.489917  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
277 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.69 
 
 
273 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4035  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.08 
 
 
270 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.65 
 
 
277 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.619722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1740  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32 
 
 
266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.986821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.194012 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3049  transmembrane ABC transporter protein  30.53 
 
 
276 aa  151  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0698875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.53 
 
 
276 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3737  ABC transporter, permease protein  32.23 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103253  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  33.96 
 
 
306 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
303 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.96233  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.83 
 
 
315 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
280 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
276 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00520375  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2225  putative sugar ABC transport system, permease component  31.99 
 
 
268 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279383  normal  0.0771654 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
277 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
287 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.48 
 
 
276 aa  150  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188981  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.95 
 
 
276 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402616  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
288 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3632  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.22 
 
 
266 aa  149  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.469815 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
276 aa  149  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.746379  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
273 aa  148  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
282 aa  148  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.148301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
276 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.68 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780875  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.967009  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11102  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.27 
 
 
266 aa  147  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15020  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
285 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0917  putative ABC transporter, permease protein  31.8 
 
 
276 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.693648 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0377  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
297 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.135278  normal  0.390253 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0093  ABC sorbitol/mannitol transporter, inner membrane subunit  34.1 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  30.38 
 
 
275 aa  145  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  33.22 
 
 
280 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
283 aa  145  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
305 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.576524 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.38 
 
 
319 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
289 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
296 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
289 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.07 
 
 
297 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
289 aa  145  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
296 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>