More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4076 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4076  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  569  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.390535  normal  0.378627 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.99 
 
 
292 aa  291  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.152491  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2557  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.99 
 
 
292 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2602  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.99 
 
 
292 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.164505  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.36 
 
 
294 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
288 aa  276  3e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.68 
 
 
285 aa  250  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.91 
 
 
279 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3227  putative sugar ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
285 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0108394  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.36 
 
 
285 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
285 aa  202  6e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.13 
 
 
277 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.88 
 
 
286 aa  191  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 
255 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 
271 aa  176  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
289 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
277 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
276 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  33.21 
 
 
275 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.93 
 
 
276 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.746379  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.34 
 
 
253 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.17 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00520375  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.25 
 
 
269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.489917  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.77 
 
 
286 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
273 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
317 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
277 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
274 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0962  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.76 
 
 
277 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0871909  hitchhiker  0.000355781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.99 
 
 
283 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.61 
 
 
277 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
293 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.04 
 
 
283 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
276 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11102  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.33 
 
 
289 aa  159  5e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
280 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
315 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
276 aa  159  7e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402616  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
276 aa  158  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
265 aa  158  9e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0908154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0093  ABC sorbitol/mannitol transporter, inner membrane subunit  35.59 
 
 
276 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.86 
 
 
298 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
276 aa  158  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.967009  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.29 
 
 
276 aa  158  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
276 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.194012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  33.45 
 
 
272 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
276 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.576524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
317 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
276 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.148301 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
274 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639619  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
280 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
277 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
284 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
288 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
291 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  36.19 
 
 
291 aa  152  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
276 aa  152  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.82 
 
 
267 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2665  ABC sugar (glycerol) transporter, inner membrane subunit  32.82 
 
 
267 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
286 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
287 aa  152  5e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3932  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.27 
 
 
277 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.410983  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3569  ABC transporter membrane spanning protein (sorbitol/mannitol)  32.37 
 
 
276 aa  152  5.9999999999999996e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  34.98 
 
 
275 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  33.2 
 
 
277 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  34.98 
 
 
275 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.77 
 
 
278 aa  152  8e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
296 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06510  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.23 
 
 
282 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
274 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  34.72 
 
 
280 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.5 
 
 
276 aa  150  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188981  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1204  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.06 
 
 
267 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.286919  normal  0.719506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
270 aa  150  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
285 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
273 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00970334  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
295 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
277 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.619722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
268 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4065  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
268 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.09 
 
 
266 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
284 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
270 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00885853  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
281 aa  149  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
292 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4213  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
268 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
296 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780875  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
275 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1740  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.84 
 
 
266 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.986821 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5924  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.12 
 
 
283 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755029  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
283 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.062126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
283 aa  148  9e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.776263  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
283 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3049  transmembrane ABC transporter protein  30.39 
 
 
276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0698875 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>