More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0701 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
315 aa  632  1e-180  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.32 
 
 
317 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.76 
 
 
317 aa  449  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.39 
 
 
317 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.17 
 
 
319 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.26 
 
 
319 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
316 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  34.58 
 
 
275 aa  188  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
275 aa  183  3e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
293 aa  182  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
274 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
291 aa  176  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  33.91 
 
 
291 aa  176  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
292 aa  176  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.54 
 
 
286 aa  175  8e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.99 
 
 
289 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
306 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
289 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
289 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
289 aa  169  6e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.39 
 
 
287 aa  169  7e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
283 aa  168  9e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
316 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.32 
 
 
278 aa  166  4e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.34 
 
 
279 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  33.67 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.65 
 
 
286 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
275 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  34.75 
 
 
277 aa  163  5.0000000000000005e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  33.67 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
288 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  33.78 
 
 
306 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  33.67 
 
 
275 aa  162  7e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
276 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.746379  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
271 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.39 
 
 
284 aa  160  2e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  34.04 
 
 
277 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
277 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
273 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
278 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
276 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
296 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
273 aa  159  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.14 
 
 
277 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.56 
 
 
296 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
276 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2231  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
276 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0964612  normal  0.170787 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.69 
 
 
277 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  33.33 
 
 
277 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.35 
 
 
280 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.96233  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
275 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.68 
 
 
276 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
272 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.598675  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3582  hypothetical protein  30.26 
 
 
278 aa  154  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.928396  normal  0.804079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20470  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.08 
 
 
289 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0780045  normal  0.389193 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2053  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
285 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.56 
 
 
283 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000450076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  31.4 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
286 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  32.26 
 
 
276 aa  153  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269935  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
280 aa  153  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.97 
 
 
277 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.23 
 
 
283 aa  153  4e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  31.4 
 
 
277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.81 
 
 
280 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  41.03 
 
 
280 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3569  ABC transporter membrane spanning protein (sorbitol/mannitol)  33.68 
 
 
276 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2045  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
266 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
276 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.44 
 
 
253 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
277 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.619722 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
276 aa  152  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.967009  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.49 
 
 
278 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3049  transmembrane ABC transporter protein  31.63 
 
 
276 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0698875 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0697  mannitol ABC transporter, permease protein  34.8 
 
 
285 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.83 
 
 
277 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.44 
 
 
276 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11102  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2263  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
266 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000192828 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3737  ABC transporter, permease protein  30.56 
 
 
266 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1740  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  30.56 
 
 
266 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.139142  normal  0.986821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
266 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.926994  hitchhiker  0.00696056 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
273 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136412  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.19 
 
 
269 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1896  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.89 
 
 
266 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.141997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3980  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.51 
 
 
296 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.780875  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
283 aa  149  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.776263  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.52 
 
 
295 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0878  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
288 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0874  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
288 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1037  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  34.92 
 
 
288 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
277 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0081  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
288 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0633  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  34.92 
 
 
288 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>