More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0917 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0917  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 
276 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.693648 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.45 
 
 
276 aa  433  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75 
 
 
276 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.64 
 
 
276 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.746379  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  74.28 
 
 
276 aa  428  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.19 
 
 
276 aa  424  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.576524 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  73.91 
 
 
276 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188981  normal  0.648438 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3569  ABC transporter membrane spanning protein (sorbitol/mannitol)  70.65 
 
 
276 aa  411  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0093  ABC sorbitol/mannitol transporter, inner membrane subunit  70.29 
 
 
276 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.29 
 
 
276 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11102  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.57 
 
 
276 aa  400  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00520375  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.2 
 
 
276 aa  395  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.194012 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.01 
 
 
276 aa  395  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.148301 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.12 
 
 
276 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.967009  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.48 
 
 
274 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639619  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1683  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  71.74 
 
 
276 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.58 
 
 
276 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402616  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  68.85 
 
 
277 aa  360  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.28 
 
 
276 aa  358  7e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  67.31 
 
 
277 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  66.92 
 
 
277 aa  350  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.77 
 
 
273 aa  347  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.38 
 
 
283 aa  343  1e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.776263  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.54 
 
 
273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65 
 
 
277 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  64.62 
 
 
277 aa  342  4e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.87 
 
 
277 aa  342  5e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  64.31 
 
 
283 aa  342  5e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644522  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0722  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  63.16 
 
 
291 aa  341  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409325  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  64.23 
 
 
277 aa  341  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65 
 
 
283 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.062126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65 
 
 
283 aa  341  8e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  67.31 
 
 
276 aa  340  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269935  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5924  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  65 
 
 
283 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755029  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.5 
 
 
288 aa  339  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180177  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.46 
 
 
291 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.05565  normal  0.793563 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4323  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.27 
 
 
277 aa  338  4e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.296556  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.87 
 
 
283 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114445  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2142  transmembrane ABC transporter protein  62.03 
 
 
286 aa  335  3.9999999999999995e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000847847  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  65.87 
 
 
283 aa  335  5e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0200189  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.85 
 
 
275 aa  334  1e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.65 
 
 
275 aa  333  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1037  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  65.08 
 
 
288 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0633  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  65.08 
 
 
288 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0081  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  65.08 
 
 
288 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2467  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  65.08 
 
 
288 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0874  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  65.08 
 
 
288 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0878  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  65.08 
 
 
288 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0697  mannitol ABC transporter, permease protein  63.89 
 
 
285 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.38 
 
 
274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.32 
 
 
272 aa  309  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.598675  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.93 
 
 
276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.350375 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  58.08 
 
 
273 aa  300  1e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136412  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  57.36 
 
 
276 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3169  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.7 
 
 
280 aa  287  1e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0455559  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2060  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.87 
 
 
273 aa  278  7e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.733103 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0156  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.13 
 
 
273 aa  276  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.441233 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.09 
 
 
284 aa  275  8e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
289 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
289 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.12 
 
 
289 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.11 
 
 
298 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0715797  normal  0.139335 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.38 
 
 
297 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
294 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0958976 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  36.61 
 
 
272 aa  167  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
306 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.402827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
317 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.7 
 
 
275 aa  159  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
286 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
285 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.82 
 
 
288 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3582  hypothetical protein  33.96 
 
 
278 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.928396  normal  0.804079 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
286 aa  154  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
282 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  35.55 
 
 
275 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
317 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.55 
 
 
275 aa  152  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
286 aa  152  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  35.55 
 
 
275 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.25 
 
 
277 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.28 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.69 
 
 
315 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.8 
 
 
255 aa  146  3e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
305 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  34.88 
 
 
275 aa  146  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.45 
 
 
293 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  32.53 
 
 
306 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1754  putative ABC transporter (permease protein)  33.46 
 
 
274 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300196  normal  0.512561 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
278 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.58 
 
 
317 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.75 
 
 
306 aa  143  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.08 
 
 
316 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.37 
 
 
274 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
271 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  0.0825161 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4035  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.52 
 
 
270 aa  142  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
276 aa  142  8e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
278 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0256  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.66 
 
 
278 aa  141  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
267 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>