More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7723 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
279 aa  544  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.09 
 
 
277 aa  360  1e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.18 
 
 
322 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.99 
 
 
299 aa  250  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  51.43 
 
 
283 aa  242  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  45.8 
 
 
283 aa  236  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  50.56 
 
 
275 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.33 
 
 
273 aa  206  3e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
281 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
275 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.73 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.177084  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
271 aa  178  9e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
296 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
307 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151676  hitchhiker  0.00569855 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.2 
 
 
286 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 
281 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.03 
 
 
296 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.92 
 
 
280 aa  170  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
306 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
276 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
277 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
282 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
275 aa  169  6e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3556  putative ABC transporter permease protein  36.47 
 
 
302 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.29 
 
 
296 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  38.78 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
279 aa  166  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
277 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
303 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.38 
 
 
275 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.09 
 
 
306 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.09 
 
 
307 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.642563  decreased coverage  0.0000998416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809225  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  36.86 
 
 
275 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.58 
 
 
278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
276 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
293 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
312 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
297 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.3 
 
 
277 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0070  sugar ABC transporter permease  36.67 
 
 
271 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.57 
 
 
276 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.94 
 
 
277 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.94 
 
 
311 aa  159  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
285 aa  158  9e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
279 aa  158  1e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
306 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  34.4 
 
 
272 aa  157  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
276 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.49 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
299 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0255144 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.69 
 
 
283 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
275 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  37.36 
 
 
275 aa  156  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
283 aa  156  4e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
281 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
288 aa  156  4e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.21 
 
 
292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.44 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.36 
 
 
275 aa  155  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
276 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.621344  normal  0.190746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.46 
 
 
297 aa  155  8e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.15 
 
 
276 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
280 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.07 
 
 
301 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
281 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.53 
 
 
283 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.83 
 
 
311 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.16 
 
 
274 aa  153  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.66 
 
 
277 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
293 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
291 aa  153  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.56 
 
 
283 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
275 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0802  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
269 aa  152  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.489917  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.34 
 
 
299 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
286 aa  152  5e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.98 
 
 
298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2070  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0665879  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
255 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
281 aa  151  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
298 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4615  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.22 
 
 
295 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
285 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3714  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.72 
 
 
294 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.273471 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.86 
 
 
277 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0625  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.15 
 
 
298 aa  150  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
271 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.66 
 
 
295 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
278 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.55 
 
 
277 aa  149  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.23 
 
 
274 aa  149  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.97 
 
 
277 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
289 aa  149  5e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 
280 aa  149  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>