More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1415 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_1415  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
292 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.58 
 
 
291 aa  558  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2099  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  86.51 
 
 
307 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.642563  decreased coverage  0.0000998416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  87.06 
 
 
306 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.516891  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2890  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  88.81 
 
 
312 aa  513  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.908761  normal  0.323454 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3644  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.17 
 
 
306 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.433095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3556  putative ABC transporter permease protein  84.43 
 
 
302 aa  502  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3958  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  86.51 
 
 
308 aa  494  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.809225  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.28 
 
 
311 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.578248 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  68.28 
 
 
299 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.494114 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4330  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  69.31 
 
 
299 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0255144 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  67.12 
 
 
291 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0498  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.06 
 
 
219 aa  255  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3122  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  47.69 
 
 
281 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3316  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
281 aa  236  4e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.72 
 
 
281 aa  235  8e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
284 aa  229  5e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 
281 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150444  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0008  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.17 
 
 
295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2548  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.56 
 
 
304 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00362276  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
303 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.265009  normal  0.0499964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4119  ABC transporter permease protein  38.1 
 
 
303 aa  201  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0396939  normal  0.542053 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
275 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.89 
 
 
277 aa  178  8e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1810  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.817708  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  36.8 
 
 
275 aa  162  6e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.87 
 
 
276 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.577285  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1957  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.43 
 
 
280 aa  159  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.605299  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.63 
 
 
275 aa  159  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01289  predicted sugar transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  36.07 
 
 
280 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
280 aa  159  7e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.240108  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01300  hypothetical protein  36.07 
 
 
280 aa  159  7e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1427  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
280 aa  159  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
280 aa  159  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1522  putative sugar ABC transporter, permease protein  36.07 
 
 
280 aa  159  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.12 
 
 
282 aa  158  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.77 
 
 
277 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
280 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.250115 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
278 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0887  sugar ABC transporter, permease protein  34.72 
 
 
280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453961  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
277 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.58 
 
 
280 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
277 aa  155  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.67 
 
 
277 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2957  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
280 aa  152  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.41482 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.38 
 
 
285 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  36.15 
 
 
283 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.91 
 
 
297 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.92 
 
 
292 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.09 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.29 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0280  ABC transporter, inner membrane subunit  33.69 
 
 
280 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.787211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
271 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  33.7 
 
 
272 aa  145  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.22 
 
 
283 aa  145  7.0000000000000006e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
279 aa  145  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0023  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
277 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.275556  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
288 aa  145  9e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
291 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
286 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5200  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
271 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.685712  normal  0.0825161 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
281 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
276 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.173525 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.23 
 
 
275 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.85 
 
 
281 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 
291 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
271 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0761213  normal  0.695628 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  37.39 
 
 
295 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.11 
 
 
288 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5211  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32 
 
 
281 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610418 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4398  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
292 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.445244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1241  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
283 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.23 
 
 
275 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.82 
 
 
291 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3984100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0500  putative sugar uptake ABC transporter permease protein  61.94 
 
 
146 aa  143  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.15 
 
 
296 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
275 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5474  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
280 aa  142  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.9066  normal  0.435889 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.56 
 
 
296 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
275 aa  142  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0260  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.21 
 
 
280 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.94 
 
 
275 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
277 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.062682  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
283 aa  141  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00800  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.61 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.303025  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
282 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.87 
 
 
275 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.01 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.333529  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
276 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
277 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>