More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_05730 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_05730  carbohydrate ABC transporter membrane protein  100 
 
 
308 aa  607  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.177084  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.96 
 
 
307 aa  296  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.151676  hitchhiker  0.00569855 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.1 
 
 
271 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1047  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.28 
 
 
303 aa  265  8e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0846293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.39 
 
 
273 aa  220  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.14 
 
 
296 aa  212  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2192  putative sugar ABC transporter, permease protein  40.78 
 
 
283 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.07 
 
 
276 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.27 
 
 
299 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.22 
 
 
322 aa  198  9e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.171707  normal  0.684803 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7719  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.16 
 
 
283 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1103  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.86 
 
 
283 aa  190  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.216355  normal  0.105298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25430  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.35 
 
 
275 aa  188  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0542318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 
281 aa  185  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.121796  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
277 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7723  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0070  sugar ABC transporter permease  33.11 
 
 
271 aa  174  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
283 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.21 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
283 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
278 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00136246  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
278 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
274 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
281 aa  165  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1682  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
275 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.299262  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.95 
 
 
279 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
282 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
277 aa  161  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
275 aa  160  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.58 
 
 
277 aa  160  2e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2542  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
275 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.607728  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
277 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02950  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.87 
 
 
297 aa  159  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1089  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.43 
 
 
298 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0183052 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3853  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
275 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0623628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
277 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19870  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.92 
 
 
285 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.46 
 
 
297 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.33 
 
 
292 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
298 aa  156  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
276 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.54 
 
 
278 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
307 aa  155  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0589  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
283 aa  155  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.288724  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.47 
 
 
271 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04600  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
277 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
296 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.85 
 
 
276 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.72 
 
 
281 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
277 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.353789  normal  0.790416 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3672  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.69 
 
 
277 aa  152  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.191343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2303  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
275 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.313337  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
305 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
288 aa  152  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0399  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.77 
 
 
286 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
303 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.05 
 
 
316 aa  151  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
281 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3353  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.35 
 
 
299 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
277 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19780  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
253 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.21 
 
 
282 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  33.45 
 
 
275 aa  149  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 
291 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  31.83 
 
 
291 aa  149  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
293 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
275 aa  149  6e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
311 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00417428  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1018  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.49 
 
 
289 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062951  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1845  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
295 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352716  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2624  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313327  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6526  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0292278 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.29 
 
 
278 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
289 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
288 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.25 
 
 
293 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  hitchhiker  0.00160002 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
275 aa  146  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.21 
 
 
292 aa  145  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1500  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  0.943286 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.74 
 
 
289 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.67 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03720  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.14 
 
 
298 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.652933 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0306  sugar ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
275 aa  145  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.147324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.94 
 
 
295 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.67 
 
 
278 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0760  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.69 
 
 
280 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0312496  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0078  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  33.45 
 
 
293 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
283 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.345018 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1418  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.07 
 
 
276 aa  144  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.24 
 
 
281 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3685  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
299 aa  143  3e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0809  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
281 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
288 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.61 
 
 
316 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
273 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00118636  normal  0.712976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>