More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0703 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
289 aa  577  1e-164  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.35 
 
 
280 aa  305  7e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.62 
 
 
280 aa  298  7e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.26 
 
 
279 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.26 
 
 
279 aa  296  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  50.37 
 
 
280 aa  281  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
280 aa  281  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.63 
 
 
280 aa  281  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  49.25 
 
 
280 aa  280  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  48.51 
 
 
305 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.64 
 
 
280 aa  267  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.14 
 
 
280 aa  264  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216167  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.29 
 
 
295 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
282 aa  244  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
282 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 
283 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  42.29 
 
 
283 aa  238  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  42.29 
 
 
283 aa  238  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.5 
 
 
299 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.83 
 
 
297 aa  229  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.53 
 
 
281 aa  224  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
281 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
301 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
426 aa  218  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0221  ABC-type maltose transport system, permease component  41.64 
 
 
285 aa  217  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000326083  hitchhiker  0.00000000101218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.98 
 
 
278 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  40.93 
 
 
291 aa  217  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.56 
 
 
307 aa  216  4e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  42.24 
 
 
278 aa  212  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.54 
 
 
319 aa  211  1e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.62 
 
 
300 aa  207  2e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.28 
 
 
289 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
293 aa  202  7e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.52 
 
 
293 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  38.43 
 
 
333 aa  197  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.33 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.18 
 
 
295 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
306 aa  195  7e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.7 
 
 
292 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
316 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.94 
 
 
311 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
325 aa  189  7e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1297  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
307 aa  187  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1855  ABC-type maltose transport system, permease component  38.7 
 
 
285 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.780572  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.87 
 
 
442 aa  186  3e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.89 
 
 
442 aa  186  4e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.340361  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
746 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.54 
 
 
833 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  32.12 
 
 
278 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.54 
 
 
833 aa  183  3e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
277 aa  183  3e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
288 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.65 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
302 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 
301 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.89 
 
 
305 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.83 
 
 
275 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.45 
 
 
297 aa  177  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
281 aa  175  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.58 
 
 
870 aa  176  6e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
317 aa  175  8e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.56 
 
 
458 aa  174  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360729  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
297 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.16 
 
 
803 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
793 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
277 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.33 
 
 
297 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  40.23 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.72 
 
 
297 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  29.29 
 
 
283 aa  172  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
292 aa  169  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
277 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6763  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
276 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.18605  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0403  putative integral membrane transport protein  31.52 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3897  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.37 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.965768  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
276 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.590535  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
277 aa  159  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
297 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464433  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
296 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
279 aa  157  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0750  sugar ABC transporter, permease protein, putative  31.88 
 
 
275 aa  157  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
823 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
277 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
282 aa  157  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00655693  normal  0.897951 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
823 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
277 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6792  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
285 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0700  putative sugar ABC transporter, permease protein  31.52 
 
 
275 aa  156  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.480284  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>