More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04120 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  100 
 
 
305 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
289 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.08 
 
 
280 aa  255  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
279 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.13 
 
 
279 aa  250  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.79 
 
 
280 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  44.78 
 
 
280 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
280 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.36 
 
 
280 aa  240  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  45.15 
 
 
280 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
282 aa  226  3e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.95 
 
 
282 aa  225  8e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 
295 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
280 aa  222  7e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
299 aa  220  3e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.48 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  43.48 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  43.48 
 
 
283 aa  216  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  41.67 
 
 
278 aa  205  1e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.07 
 
 
281 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.49 
 
 
278 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
301 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
297 aa  194  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  35.93 
 
 
291 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.41 
 
 
281 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
297 aa  189  5.999999999999999e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
426 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.29 
 
 
319 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0221  ABC-type maltose transport system, permease component  38.52 
 
 
285 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000326083  hitchhiker  0.00000000101218 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  37.13 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.54 
 
 
307 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1297  ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
307 aa  181  2e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.22 
 
 
289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
293 aa  175  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.89 
 
 
300 aa  175  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.91 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.03 
 
 
325 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.2 
 
 
278 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.93 
 
 
306 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  34.26 
 
 
295 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.71 
 
 
292 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
283 aa  168  9e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.76 
 
 
326 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.95 
 
 
283 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
316 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
301 aa  165  9e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
300 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
288 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.06 
 
 
870 aa  159  5e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 
297 aa  159  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
302 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 
297 aa  157  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40 
 
 
305 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1855  ABC-type maltose transport system, permease component  35.5 
 
 
285 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.780572  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0067  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  156  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.6 
 
 
301 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.67 
 
 
275 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
746 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
277 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.31192  normal  0.345507 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.97 
 
 
277 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.71 
 
 
803 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
833 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12270  ABC-type maltose transport systems, permease component  36.86 
 
 
299 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0080495  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.45 
 
 
317 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
833 aa  153  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.96 
 
 
281 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  36.03 
 
 
283 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.28 
 
 
442 aa  152  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.61 
 
 
299 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
793 aa  149  4e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  36.04 
 
 
296 aa  149  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.57 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.275064  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.3 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
442 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.340361  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  36.4 
 
 
296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.71 
 
 
295 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
458 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360729  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  36.75 
 
 
296 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.49 
 
 
277 aa  145  9e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001330  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalG  34.98 
 
 
296 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251753  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.47 
 
 
276 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
271 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.39 
 
 
307 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2632  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.08 
 
 
281 aa  144  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.52 
 
 
275 aa  144  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
823 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.3 
 
 
292 aa  142  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
823 aa  142  6e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3322  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.37 
 
 
309 aa  142  9e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0903437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>