More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1554 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  96.35 
 
 
823 aa  1608    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.01 
 
 
833 aa  701    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
823 aa  1664    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
833 aa  702    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
746 aa  568  1e-160  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
793 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.44 
 
 
803 aa  512  1e-144  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.03 
 
 
870 aa  400  9.999999999999999e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.13 
 
 
281 aa  247  6e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  47.44 
 
 
296 aa  196  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03904  maltose transporter subunit  47.2 
 
 
296 aa  195  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.2 
 
 
296 aa  195  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3997  maltose transporter permease  47.2 
 
 
296 aa  195  3e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0710551  normal  0.724914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03864  hypothetical protein  47.2 
 
 
296 aa  195  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4494  maltose transporter permease  47.2 
 
 
296 aa  195  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348431  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5513  maltose transporter permease  47.2 
 
 
296 aa  195  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  46.98 
 
 
296 aa  195  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4272  maltose transporter permease  47.2 
 
 
296 aa  195  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4583  maltose transporter permease  47.2 
 
 
296 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  46.73 
 
 
296 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  46.73 
 
 
296 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4474  maltose transporter permease  45.79 
 
 
296 aa  194  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  46.73 
 
 
296 aa  194  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  46.73 
 
 
296 aa  194  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  46.26 
 
 
296 aa  193  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3916  maltose transporter permease  45.79 
 
 
296 aa  192  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.365338  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0304  maltose transporter permease  45.79 
 
 
296 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0376  maltose transporter permease  45.79 
 
 
296 aa  192  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.977537  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  46.26 
 
 
296 aa  192  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  45.12 
 
 
296 aa  191  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
301 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  45.16 
 
 
333 aa  190  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001330  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalG  46.51 
 
 
296 aa  190  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.04 
 
 
302 aa  184  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  45.79 
 
 
291 aa  183  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
300 aa  182  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.7 
 
 
307 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.19 
 
 
297 aa  181  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464433  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
442 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.62 
 
 
325 aa  179  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.27 
 
 
297 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
442 aa  179  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.340361  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.86 
 
 
300 aa  178  3e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.46 
 
 
301 aa  177  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.99 
 
 
281 aa  175  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
301 aa  173  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.85 
 
 
280 aa  172  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40.72 
 
 
278 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3130  maltose transporter permease  41.47 
 
 
296 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  decreased coverage  0.00285167 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.85 
 
 
319 aa  168  4e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
280 aa  167  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
279 aa  167  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
279 aa  167  9e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.95 
 
 
289 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.47 
 
 
458 aa  165  3e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360729  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
293 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.74 
 
 
280 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
293 aa  164  7e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.47 
 
 
295 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.24 
 
 
292 aa  163  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.47 
 
 
277 aa  161  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
317 aa  160  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
276 aa  159  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.4 
 
 
280 aa  159  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
280 aa  159  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.67 
 
 
283 aa  158  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.17 
 
 
280 aa  158  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.53 
 
 
283 aa  157  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
289 aa  157  9e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.46 
 
 
305 aa  155  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  39.53 
 
 
278 aa  151  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  41.82 
 
 
283 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  38.7 
 
 
297 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.85 
 
 
316 aa  149  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  39.38 
 
 
297 aa  147  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  37.5 
 
 
292 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
311 aa  145  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
306 aa  144  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  37.85 
 
 
305 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12270  ABC-type maltose transport systems, permease component  41.31 
 
 
299 aa  142  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0080495  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
283 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
281 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  37.38 
 
 
283 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  37.38 
 
 
283 aa  138  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
299 aa  137  8e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
304 aa  137  8e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
282 aa  137  9e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
282 aa  137  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  32.27 
 
 
269 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  37.33 
 
 
278 aa  135  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3555  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
279 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
296 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>