More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2960 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  98.94 
 
 
282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  84.34 
 
 
283 aa  481  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.34 
 
 
283 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  84.34 
 
 
283 aa  481  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  81.91 
 
 
299 aa  473  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.08 
 
 
280 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  62.01 
 
 
280 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  62.01 
 
 
280 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.01 
 
 
280 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.1 
 
 
280 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
279 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.82 
 
 
279 aa  293  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.6 
 
 
280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.7 
 
 
289 aa  244  9e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  41.95 
 
 
305 aa  225  7e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.93 
 
 
297 aa  215  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  39.72 
 
 
333 aa  212  4.9999999999999996e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
280 aa  212  7e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216167  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
281 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.86 
 
 
307 aa  209  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.65 
 
 
297 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.7 
 
 
300 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
301 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.24 
 
 
281 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.71 
 
 
325 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.7 
 
 
300 aa  202  5e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  38.24 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.6 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.59 
 
 
289 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
293 aa  196  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.64 
 
 
293 aa  195  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.71 
 
 
302 aa  193  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  36.99 
 
 
295 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.46 
 
 
295 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
297 aa  191  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0221  ABC-type maltose transport system, permease component  38.06 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000326083  hitchhiker  0.00000000101218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.24 
 
 
301 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  39.93 
 
 
283 aa  189  4e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  36.53 
 
 
319 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
278 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
426 aa  183  3e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
278 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.81 
 
 
317 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.77 
 
 
283 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.7 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.75 
 
 
316 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1297  ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
307 aa  167  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  34.08 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
292 aa  163  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  33.71 
 
 
297 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
277 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
281 aa  162  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05440  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.1 
 
 
307 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.050978  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  31.88 
 
 
278 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
311 aa  159  4e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
297 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3916  maltose transporter permease  32.31 
 
 
296 aa  159  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.365338  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0304  maltose transporter permease  32.31 
 
 
296 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254355  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0376  maltose transporter permease  32.31 
 
 
296 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.977537  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.39 
 
 
442 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
288 aa  158  8e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217839  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
276 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 
746 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1855  ABC-type maltose transport system, permease component  35.25 
 
 
285 aa  156  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.780572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0528  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.23 
 
 
281 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00417189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.21 
 
 
292 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.06 
 
 
793 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.65 
 
 
442 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.340361  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.51 
 
 
279 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  31.74 
 
 
296 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  33.21 
 
 
296 aa  153  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  31.74 
 
 
296 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.95 
 
 
302 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  33.58 
 
 
296 aa  153  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4474  maltose transporter permease  31.06 
 
 
296 aa  152  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  31.74 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  31.74 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3327  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 
278 aa  152  7e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  32.39 
 
 
296 aa  152  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
296 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  31.4 
 
 
296 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  30.86 
 
 
276 aa  150  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
289 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
870 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.47 
 
 
275 aa  150  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
302 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341564  decreased coverage  0.00499995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.2 
 
 
277 aa  150  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3130  maltose transporter permease  32.48 
 
 
296 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  decreased coverage  0.00285167 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.14 
 
 
803 aa  149  4e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31 
 
 
275 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>