More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0916 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.19 
 
 
299 aa  512  1e-144  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  84.34 
 
 
282 aa  494  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  83.99 
 
 
282 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.44 
 
 
280 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  63.44 
 
 
280 aa  378  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  62.37 
 
 
280 aa  374  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.72 
 
 
280 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 
279 aa  291  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.71 
 
 
279 aa  291  8e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.75 
 
 
280 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.75 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.09 
 
 
280 aa  262  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
289 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.5 
 
 
297 aa  226  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  43.08 
 
 
305 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  42.2 
 
 
333 aa  216  2.9999999999999998e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
307 aa  214  9e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
280 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.33 
 
 
301 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
325 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
300 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.57 
 
 
297 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.46 
 
 
281 aa  204  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.21 
 
 
300 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  36.65 
 
 
291 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
295 aa  196  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
297 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  36.46 
 
 
278 aa  195  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  42.61 
 
 
305 aa  194  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.28 
 
 
289 aa  193  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.45 
 
 
293 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
293 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.62 
 
 
319 aa  190  2e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.94 
 
 
301 aa  190  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  38.66 
 
 
295 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
302 aa  188  9e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  36.79 
 
 
278 aa  186  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.5 
 
 
426 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0221  ABC-type maltose transport system, permease component  34.62 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000326083  hitchhiker  0.00000000101218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
316 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  40.77 
 
 
283 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
317 aa  176  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.68 
 
 
283 aa  175  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  35.51 
 
 
297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  34.78 
 
 
297 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
292 aa  171  1e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
276 aa  171  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.85 
 
 
275 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  35.09 
 
 
278 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1297  ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
307 aa  168  8e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
277 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
306 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.4 
 
 
281 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  33.89 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.95 
 
 
442 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
311 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1855  ABC-type maltose transport system, permease component  34.87 
 
 
285 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.780572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  34.35 
 
 
292 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  32.56 
 
 
296 aa  159  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.35 
 
 
279 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.675174  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.45 
 
 
746 aa  158  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.11 
 
 
442 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.340361  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  32.89 
 
 
296 aa  157  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2834  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
275 aa  156  4e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.42 
 
 
283 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.63 
 
 
297 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3130  maltose transporter permease  31.89 
 
 
296 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  decreased coverage  0.00285167 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001330  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalG  32.56 
 
 
296 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251753  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
793 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0029  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.54 
 
 
283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000511748  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4474  maltose transporter permease  31.89 
 
 
296 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  31.89 
 
 
296 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  31.89 
 
 
296 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  31.89 
 
 
296 aa  152  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  31.89 
 
 
296 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  31.89 
 
 
296 aa  152  8.999999999999999e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0352  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
277 aa  151  8.999999999999999e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  31.56 
 
 
296 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.77 
 
 
277 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
870 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
833 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0376  maltose transporter permease  31.46 
 
 
296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.977537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3916  maltose transporter permease  31.46 
 
 
296 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.365338  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
833 aa  149  4e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0304  maltose transporter permease  31.46 
 
 
296 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254355  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.83 
 
 
296 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.17 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1057  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.76 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.233223  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>