More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0963 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0963  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
302 aa  590  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341564  decreased coverage  0.00499995 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29430  ABC-type sugar transport system, permease component  66.56 
 
 
298 aa  391  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29400  carbohydrate ABC transporter membrane protein  43.49 
 
 
305 aa  241  7e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.709644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.49 
 
 
289 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467109  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1083  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.91 
 
 
301 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521844  normal  0.416861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.83 
 
 
297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.98 
 
 
300 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.385749  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2874  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.43 
 
 
304 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0465217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15321  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
275 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2510  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  37.23 
 
 
278 aa  192  9e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.686515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
284 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  35.34 
 
 
281 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.26 
 
 
271 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  35.38 
 
 
276 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
275 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.47 
 
 
301 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2724  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.98 
 
 
290 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.191447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0043  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
270 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.87 
 
 
279 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2748  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.5 
 
 
306 aa  177  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925228  normal  0.18236 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  37.64 
 
 
269 aa  177  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.22 
 
 
274 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.24 
 
 
295 aa  176  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2586  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
294 aa  175  8e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000948808  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4081  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
275 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 
273 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.96 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.36 
 
 
280 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3536  putative sugar transporter, permease protein  36.92 
 
 
282 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.15 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  35.55 
 
 
275 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
299 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0255  ABC-type maltose transport system, permease component  34.18 
 
 
276 aa  170  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.8 
 
 
280 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
283 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
270 aa  170  3e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  35.27 
 
 
280 aa  169  4e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  37.85 
 
 
273 aa  169  7e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.85 
 
 
272 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  35.85 
 
 
272 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.36 
 
 
277 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
301 aa  168  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1550  MalG-type ABC sugar transport system permease component  33.11 
 
 
308 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5580  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
280 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.14397 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.72 
 
 
287 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.4 
 
 
273 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.256296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.25 
 
 
275 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1700  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.07 
 
 
293 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 
285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
281 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1378  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.73 
 
 
743 aa  165  8e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.445152  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.08 
 
 
294 aa  165  9e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.67 
 
 
301 aa  165  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  36 
 
 
277 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1524  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.2 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3424  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  32.71 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.224569  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.377096 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.71 
 
 
310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
390 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 
281 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.302413  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  35.6 
 
 
277 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  38.14 
 
 
701 aa  162  7e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  32.55 
 
 
271 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  34.87 
 
 
277 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.55 
 
 
271 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2001  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
284 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.757856  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12340  sugar-transport integral membrane protein ABC transporter uspB  36.16 
 
 
274 aa  161  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.74 
 
 
295 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.12 
 
 
293 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
277 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000457855  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.63 
 
 
722 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06320  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.91 
 
 
298 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05240  carbohydrate ABC transporter membrane protein  32.76 
 
 
312 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
268 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3123  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
274 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.610741  hitchhiker  0.000350702 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
294 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000583333  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.84 
 
 
282 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3574  Monosaccharide-transporting ATPase  33.83 
 
 
290 aa  158  8e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.04 
 
 
275 aa  158  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.84 
 
 
271 aa  158  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00258755  normal  0.655339 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2532  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.05 
 
 
275 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4490  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.39 
 
 
287 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.091777  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  30.86 
 
 
276 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11620  ABC-type sugar transport system, permease component  29.97 
 
 
306 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00242068  normal  0.0915178 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.27 
 
 
275 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.73 
 
 
285 aa  157  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11560  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.51 
 
 
301 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.626059  hitchhiker  0.00742077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
295 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.49 
 
 
300 aa  156  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1618  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.09 
 
 
198 aa  157  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1887  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
349 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.470539 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
349 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59414  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0230  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.01 
 
 
298 aa  156  4e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
308 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.96 
 
 
277 aa  156  4e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.97 
 
 
277 aa  156  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1515  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.11 
 
 
302 aa  155  6e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1730  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.15 
 
 
285 aa  155  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000816013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>