More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4569 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  100 
 
 
296 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  100 
 
 
296 aa  587  1e-167  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  99.66 
 
 
296 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  99.32 
 
 
296 aa  584  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  99.66 
 
 
296 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  96.96 
 
 
296 aa  578  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03904  maltose transporter subunit  93.92 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  93.92 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4494  maltose transporter permease  93.92 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348431  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5513  maltose transporter permease  93.92 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4272  maltose transporter permease  93.92 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3997  maltose transporter permease  93.92 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0710551  normal  0.724914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4583  maltose transporter permease  93.58 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03864  hypothetical protein  93.92 
 
 
296 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4474  maltose transporter permease  90.54 
 
 
296 aa  537  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0376  maltose transporter permease  90.54 
 
 
296 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.977537  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3916  maltose transporter permease  90.54 
 
 
296 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.365338  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0304  maltose transporter permease  90.54 
 
 
296 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254355  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  82.09 
 
 
296 aa  492  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  82.77 
 
 
296 aa  491  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001330  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalG  82.43 
 
 
296 aa  488  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251753  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  82.09 
 
 
296 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3130  maltose transporter permease  72.64 
 
 
296 aa  429  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  decreased coverage  0.00285167 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.07 
 
 
297 aa  353  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464433  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.47 
 
 
793 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
281 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.87 
 
 
870 aa  198  9e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.5 
 
 
803 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
833 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
823 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.37 
 
 
833 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.73 
 
 
823 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  41.38 
 
 
278 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.44 
 
 
746 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.48 
 
 
281 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.64 
 
 
319 aa  187  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
301 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
280 aa  178  9e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  39.32 
 
 
280 aa  177  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.97 
 
 
442 aa  177  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
280 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  40.59 
 
 
333 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
280 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  38.87 
 
 
291 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
300 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.66 
 
 
307 aa  172  6.999999999999999e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
442 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.340361  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.07 
 
 
280 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.02 
 
 
297 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.36 
 
 
300 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.79 
 
 
325 aa  167  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12270  ABC-type maltose transport systems, permease component  39.58 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0080495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.06 
 
 
295 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.84 
 
 
302 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.72 
 
 
458 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360729  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.64 
 
 
293 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.86 
 
 
317 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
279 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
281 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
279 aa  158  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.98 
 
 
306 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.15 
 
 
301 aa  156  4e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.78 
 
 
311 aa  155  6e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
293 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
282 aa  155  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.76 
 
 
299 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.59 
 
 
280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  38.49 
 
 
283 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
292 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
282 aa  152  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  38.65 
 
 
305 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
289 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.73 
 
 
283 aa  151  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  41.4 
 
 
283 aa  148  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 
297 aa  149  8e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  31.89 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  31.89 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  38.01 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  41.2 
 
 
278 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  33.56 
 
 
297 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.35 
 
 
316 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
277 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
289 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.32 
 
 
276 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
426 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0221  ABC-type maltose transport system, permease component  30.87 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000326083  hitchhiker  0.00000000101218 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.9 
 
 
277 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.161716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  31.97 
 
 
278 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.19 
 
 
280 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>