More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2345 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
288 aa  576  1.0000000000000001e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000217839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.24 
 
 
426 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1297  ABC transporter, permease protein  51.77 
 
 
307 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1443  maltose ABC transporter, permease protein  50.71 
 
 
278 aa  293  2e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00135635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0221  ABC-type maltose transport system, permease component  51.81 
 
 
285 aa  273  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000326083  hitchhiker  0.00000000101218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1855  ABC-type maltose transport system, permease component  47.37 
 
 
285 aa  233  2.0000000000000002e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.780572  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.64 
 
 
289 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
279 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
279 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  40 
 
 
280 aa  176  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.01 
 
 
280 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.23 
 
 
280 aa  175  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  38.85 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.46 
 
 
280 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
280 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.1 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  34.53 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.09 
 
 
280 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216167  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
282 aa  158  8e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
282 aa  158  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.8 
 
 
280 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.09 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
281 aa  152  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  31.96 
 
 
319 aa  152  7e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
289 aa  152  8e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0132  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.81 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
283 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
299 aa  145  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  32.31 
 
 
283 aa  145  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  32.31 
 
 
283 aa  145  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
870 aa  145  8.000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
803 aa  145  9e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
301 aa  145  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.71 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  33.45 
 
 
333 aa  140  3e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  32.53 
 
 
291 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.5 
 
 
793 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  30.74 
 
 
278 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11600  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.85 
 
 
283 aa  135  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  30.96 
 
 
292 aa  135  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.55 
 
 
297 aa  135  9e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2154  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34 
 
 
295 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.13 
 
 
293 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.46 
 
 
293 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  31.72 
 
 
278 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.93 
 
 
316 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.523457 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.6 
 
 
746 aa  132  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12270  ABC-type maltose transport systems, permease component  35.47 
 
 
299 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0080495  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
833 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.81 
 
 
833 aa  130  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.61 
 
 
283 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.53 
 
 
300 aa  129  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.59 
 
 
277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  35.1 
 
 
295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.91 
 
 
301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.44 
 
 
307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.79 
 
 
297 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.58 
 
 
294 aa  126  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07090  carbohydrate ABC transporter membrane protein  30.11 
 
 
297 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484771  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4474  maltose transporter permease  28.15 
 
 
296 aa  125  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  29.57 
 
 
296 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  29.57 
 
 
296 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1021  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
246 aa  125  9e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  27.4 
 
 
294 aa  125  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.829969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.01 
 
 
297 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464433  normal  0.955687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03904  maltose transporter subunit  29.14 
 
 
296 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.14 
 
 
296 aa  123  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0376  maltose transporter permease  28.81 
 
 
296 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.977537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3997  maltose transporter permease  29.14 
 
 
296 aa  123  3e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0710551  normal  0.724914 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5513  maltose transporter permease  29.14 
 
 
296 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03864  hypothetical protein  29.14 
 
 
296 aa  123  3e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4494  maltose transporter permease  29.14 
 
 
296 aa  123  3e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348431  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  28.9 
 
 
296 aa  123  3e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3916  maltose transporter permease  28.81 
 
 
296 aa  123  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.365338  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  29.24 
 
 
296 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0304  maltose transporter permease  28.81 
 
 
296 aa  123  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254355  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  29.24 
 
 
296 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4272  maltose transporter permease  29.14 
 
 
296 aa  123  3e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.68 
 
 
306 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  29.57 
 
 
296 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 
300 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  29.24 
 
 
296 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0475  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
276 aa  123  4e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4583  maltose transporter permease  28.81 
 
 
296 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.43 
 
 
276 aa  122  7e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.77 
 
 
302 aa  122  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.73 
 
 
301 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.72 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.93 
 
 
442 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  29.24 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  33.21 
 
 
305 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  29.9 
 
 
296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  34.48 
 
 
283 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>