More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3130 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_3130  maltose transporter permease  100 
 
 
296 aa  589  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0528646  decreased coverage  0.00285167 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0296  maltose transporter permease  73.31 
 
 
296 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.422686  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0920  maltose transporter permease  72.97 
 
 
296 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05216  maltose transporter permease  71.62 
 
 
296 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001330  maltose/maltodextrin ABC transporter permease protein MalG  71.62 
 
 
296 aa  433  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.251753  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4419  maltose transporter permease  72.64 
 
 
296 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246635 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4569  maltose transporter permease  72.64 
 
 
296 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.979918 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4569  maltose transporter permease  72.64 
 
 
296 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.019276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4484  maltose transporter permease  72.64 
 
 
296 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4621  maltose transporter permease  72.3 
 
 
296 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.916562  normal  0.2555 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0236  maltose transporter permease  70.95 
 
 
296 aa  422  1e-117  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.653107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4474  maltose transporter permease  70.61 
 
 
296 aa  423  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0304  maltose transporter permease  70.27 
 
 
296 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000254355  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3916  maltose transporter permease  70.27 
 
 
296 aa  418  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.365338  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0376  maltose transporter permease  70.27 
 
 
296 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.977537  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03904  maltose transporter subunit  70.27 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3964  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.27 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5513  maltose transporter permease  70.27 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4583  maltose transporter permease  69.93 
 
 
296 aa  414  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03864  hypothetical protein  70.27 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3997  maltose transporter permease  70.27 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0710551  normal  0.724914 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4272  maltose transporter permease  70.27 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4494  maltose transporter permease  70.27 
 
 
296 aa  415  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.348431  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  63.48 
 
 
297 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464433  normal  0.955687 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1436  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.73 
 
 
870 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5854  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133464  normal  0.182587 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0710  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.63 
 
 
281 aa  182  8.000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.667982  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.81 
 
 
301 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.185029 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.13 
 
 
793 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.62 
 
 
803 aa  173  3.9999999999999995e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.470795  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22430  ABC-type maltose transport systems, permease component  39.78 
 
 
333 aa  172  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.796201  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
297 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.275002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3327  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  37.8 
 
 
278 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1616  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
823 aa  169  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.195451  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1554  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.47 
 
 
823 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.182842  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0968  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
833 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.2 
 
 
833 aa  168  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0856  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.45 
 
 
746 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.450208  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.01 
 
 
325 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.250706  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.51 
 
 
319 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.626429  normal  0.0511463 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0830  multiple sugar transport system permease protein  35.87 
 
 
291 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.765019  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2871  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
301 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.69 
 
 
299 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000378819  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
300 aa  159  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.556978 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.13 
 
 
442 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.132762  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2160  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
307 aa  156  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.493625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
293 aa  155  8e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1513  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.23 
 
 
280 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4062  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.686146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3920  maltosaccharide ABC transporter permease  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3752  maltosaccharide ABC transporter, permease  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109892  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3768  maltosaccharide ABC transporter, permease  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4227  maltosaccharide ABC transporter permease protein  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.77 
 
 
293 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4030  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4117  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.222896  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4136  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  33.68 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1122  maltosaccharide ABC transporter, permease protein  34.03 
 
 
280 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.331938  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3839  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
280 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.25 
 
 
300 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.537568  normal  0.817289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5889  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
283 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.347045 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2712  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
280 aa  153  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0142208  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3885  maltose/maltodextrin ABC transporter permease  31.89 
 
 
283 aa  152  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.321948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0916  ABC maltose/maltodextrin transporter, permease subunit  31.89 
 
 
283 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.402937  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.89 
 
 
283 aa  152  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0960519  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4134  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.23 
 
 
295 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1502  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.6 
 
 
458 aa  151  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.360729  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
279 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.990919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.56 
 
 
279 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.72 
 
 
442 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.340361  normal  0.449211 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1319  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.29 
 
 
282 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0499558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2960  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.48 
 
 
282 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2336  maltose ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12270  ABC-type maltose transport systems, permease component  36.36 
 
 
299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.0080495  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3079  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.01 
 
 
302 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.43285  normal  0.940985 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13880  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.89 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2650  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, permease protein  35.09 
 
 
297 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38 
 
 
301 aa  143  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.626246  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
292 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.796651  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2577  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.4 
 
 
289 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123664  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.99 
 
 
281 aa  142  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16170  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0163255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0942  maltose/maltodextrin transport system (permease)  34.69 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.877119  normal  0.961037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0749  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.81 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04120  ABC-type maltose transport systems, permease component  33.45 
 
 
305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4684  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.31 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0703  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
289 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
426 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.85 
 
 
275 aa  137  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20450  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.96 
 
 
277 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000244229  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.07 
 
 
311 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.736814  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2306  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.99 
 
 
280 aa  135  8e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1884  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  34.47 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.683331 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1264  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.95 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.902652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1855  ABC-type maltose transport system, permease component  31.18 
 
 
285 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.780572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
297 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.96 
 
 
280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.595578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0072  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.13 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>