More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2650 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
283 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  95.41 
 
 
283 aa  540  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2009  ABC sugar transporter inner membrane binding protein  58.3 
 
 
283 aa  353  1e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.13 
 
 
283 aa  344  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4575  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.12 
 
 
283 aa  339  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2349  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.48 
 
 
283 aa  338  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.823442  normal  0.0985455 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5199  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 
283 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 
283 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.674911  normal  0.328487 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.77 
 
 
283 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.13099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4934  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
283 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.102877 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
283 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.602642  hitchhiker  0.000196491 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4588  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.06 
 
 
283 aa  331  8e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.165576  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
283 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6026  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.42 
 
 
283 aa  329  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.548734  normal  0.778236 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4878  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.71 
 
 
283 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3287  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.71 
 
 
283 aa  325  6e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3836  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.06 
 
 
283 aa  314  9.999999999999999e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.253658  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.9 
 
 
282 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5739  ABC transporter membrane spanning protein  54.42 
 
 
284 aa  312  4.999999999999999e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0642134  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2816  putative carbohydrate ABC transporter, permease protein  54.06 
 
 
283 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1182  ABC transporter, permease protein  53.71 
 
 
283 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134405  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1246  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.55 
 
 
282 aa  298  5e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.87004 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20500  Monosaccharide-transporting ATPase  44.96 
 
 
291 aa  249  4e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00337016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.85 
 
 
280 aa  224  8e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.96 
 
 
289 aa  205  8e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4908  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.52 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3467  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
305 aa  195  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
290 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0614  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.1 
 
 
286 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
307 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.586554 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1294  glucose ABC transporter, permease protein, putative  36.26 
 
 
281 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7920  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.63 
 
 
303 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.873498  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1152  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
292 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.709264  normal  0.405077 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1115  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.74 
 
 
281 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0999  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0270666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1015  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3381  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.73 
 
 
304 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1017  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4368  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.45 
 
 
281 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.250466  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1055  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
281 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0252834  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23000  putative permease of ABC sugar transporter  37.02 
 
 
281 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1941  sugar ABC transporter permease  37.02 
 
 
281 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0206  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.32 
 
 
281 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.05 
 
 
280 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2414  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
292 aa  158  9e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.161941  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.16 
 
 
312 aa  156  3e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1172  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.88 
 
 
290 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.51 
 
 
285 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.587185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.5 
 
 
284 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
292 aa  155  6e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  34.39 
 
 
295 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2023  Monosaccharide-transporting ATPase  33.96 
 
 
295 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1922  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.22 
 
 
277 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.454551  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.87 
 
 
314 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.41 
 
 
269 aa  154  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0036  sugar ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.385725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1693  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262345 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2601  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
275 aa  151  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1380  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
323 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.208798  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.94 
 
 
271 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
277 aa  150  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2096  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.07 
 
 
314 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.18656 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  37.1 
 
 
273 aa  149  7e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2464  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
270 aa  148  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.668515  normal  0.267306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
295 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0931  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.98 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3692  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.07 
 
 
289 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.525065  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5439  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.691915  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4073  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.52 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22339  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3659  sugar ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0491  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.303102  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0970  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.52 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.86 
 
 
309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.228391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0942  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.84 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.72479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3341  putative sugar ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.118781 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.98 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.62 
 
 
274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0884  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.12 
 
 
291 aa  147  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.469576 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0842  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
285 aa  145  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3302  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.02 
 
 
273 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0830  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
285 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.39 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1555  maltose ABC transporter, permease protein, putative  31.58 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.555505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
280 aa  145  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.71 
 
 
326 aa  145  9e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7937  ABC transporter (permease)  32.62 
 
 
305 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101985  normal  0.497391 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  29.2 
 
 
277 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0691  sugar ABC transporter, permease protein, putative  32.01 
 
 
293 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
285 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0323033  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1178  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.16 
 
 
281 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1484  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
314 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3235  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.41 
 
 
315 aa  144  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.628431  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0630  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.93 
 
 
285 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434043  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0646  putative sugar ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 
293 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.313073  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0188  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.58 
 
 
277 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1726  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.17 
 
 
313 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.483631 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3784  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
314 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.36462  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  31.22 
 
 
277 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  30.86 
 
 
269 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>