197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0435 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  57.23 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  56.14 
 
 		 225 aa  197  5e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  50.85 
 
 		 181 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  51.41 
 
 		 181 aa  187  7e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.35 
 
 		 182 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  38.29 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  41.24 
 
 		 183 aa  137  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 		 182 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  42.11 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.57 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  41.34 
 
 		 181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  36.16 
 
 		 181 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.57 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  45.57 
 
 		 180 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  40.57 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  37.74 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  36.54 
 
 		 177 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  43.21 
 
 		 409 aa  114  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.48 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  32.77 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.23 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  33.53 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.86 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.95 
 
 		 172 aa  104  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.14 
 
 		 188 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  35.67 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  32 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.48 
 
 		 181 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.71 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.1 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  34.42 
 
 		 172 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.15 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.11 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.42 
 
 		 176 aa  96.3  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  35.44 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  36.81 
 
 		 227 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.93 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 178 aa  88.2  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  32.77 
 
 		 192 aa  87.4  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.43 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.82 
 
 		 178 aa  84.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  30.38 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.75 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  29.75 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.65 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  27.81 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.65 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.92 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.75 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  24.7 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.1 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  26.01 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.24 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  26.38 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  24.1 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  24.68 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.99 
 
 		 189 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.26 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  26.71 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.63 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  25.77 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  25.77 
 
 		 219 aa  64.3  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  26.45 
 
 		 189 aa  64.3  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.85 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  29.22 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.77 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  28.3 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.49 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  25.75 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  24.84 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  25.49 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.06 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2827  peroxidase-like  28.12 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00537954  normal  0.0498212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.37 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  25.6 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.22 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.24 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  24.69 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  24.52 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  27.43 
 
 		 180 aa  58.9  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  27.45 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1476  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.33 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.399629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  27.43 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  26.95 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  25.32 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1371  Carboxymuconolactone decarboxylase  26.71 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.12 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  26.67 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  26.42 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.28 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  26.25 
 
 		 177 aa  55.5  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>