155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5712 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
197 aa  411  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  48.11 
 
 
191 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  43.96 
 
 
184 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  43.96 
 
 
184 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  44.63 
 
 
180 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  44.13 
 
 
183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  44.63 
 
 
185 aa  164  9e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  42.7 
 
 
181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  38.55 
 
 
188 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  40.88 
 
 
181 aa  157  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  38.55 
 
 
183 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.5 
 
 
191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  37.02 
 
 
189 aa  131  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  36.67 
 
 
182 aa  130  9e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  33.9 
 
 
182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  31.84 
 
 
190 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.73 
 
 
186 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.73 
 
 
186 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  36.31 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  36.47 
 
 
189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  35.75 
 
 
205 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  44.17 
 
 
151 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  32.4 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.21 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  31.21 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 
213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 
189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.95 
 
 
172 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  32.58 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.68 
 
 
211 aa  109  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  29.38 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  32.02 
 
 
219 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  32.02 
 
 
186 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  31.55 
 
 
192 aa  103  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.95 
 
 
182 aa  102  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.82 
 
 
172 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 
172 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  31.79 
 
 
198 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  32.16 
 
 
172 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.52 
 
 
178 aa  97.8  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.71 
 
 
172 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.18 
 
 
184 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.55 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.62 
 
 
178 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.77 
 
 
178 aa  95.5  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.59 
 
 
178 aa  95.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  30.13 
 
 
183 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.91 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.24 
 
 
225 aa  91.7  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.15 
 
 
178 aa  91.3  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.14 
 
 
181 aa  90.5  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.09 
 
 
182 aa  89.4  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  28.48 
 
 
184 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  29.19 
 
 
177 aa  89.7  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.52 
 
 
182 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
177 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  28.82 
 
 
180 aa  87.8  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  32 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  32 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.1 
 
 
177 aa  87.4  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  32 
 
 
179 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.48 
 
 
179 aa  85.9  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.45 
 
 
177 aa  84.3  9e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  32.68 
 
 
179 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  29.45 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  27.44 
 
 
183 aa  82  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  29.09 
 
 
183 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.31 
 
 
181 aa  80.5  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.53 
 
 
182 aa  80.5  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.9 
 
 
179 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.35 
 
 
181 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.75 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  29.01 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.58 
 
 
184 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  27.88 
 
 
183 aa  74.7  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  29.93 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.85 
 
 
181 aa  72  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  28.66 
 
 
181 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.85 
 
 
181 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  24.68 
 
 
178 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  22.7 
 
 
181 aa  67.8  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  24.39 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  26.38 
 
 
409 aa  57.8  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.33 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.38 
 
 
214 aa  54.7  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.38 
 
 
176 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.71 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  21.43 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.35 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.7 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  21.35 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.67 
 
 
176 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  25.31 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  23.26 
 
 
192 aa  52  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3197  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.49 
 
 
202 aa  52  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.54 
 
 
192 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  20.96 
 
 
194 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  22.54 
 
 
192 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  23.33 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1632  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.41 
 
 
130 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.134838  normal  0.2145 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>