198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8439 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  91.16 
 
 		 181 aa  345  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  88.95 
 
 		 181 aa  342  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  75.69 
 
 		 188 aa  291  4e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  81.87 
 
 		 227 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  43.75 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  43.82 
 
 		 180 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.51 
 
 		 182 aa  148  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.17 
 
 		 184 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.53 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.71 
 
 		 182 aa  145  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.64 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  38.37 
 
 		 183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  37.93 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.93 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  36.36 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  37.36 
 
 		 172 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 		 184 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  47.1 
 
 		 409 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  43.18 
 
 		 183 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  34.73 
 
 		 172 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.77 
 
 		 181 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  37.29 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.86 
 
 		 225 aa  107  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.79 
 
 		 179 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  34.46 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  31.07 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.09 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  33.9 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.09 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 		 178 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  32.73 
 
 		 208 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  32.73 
 
 		 219 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.89 
 
 		 183 aa  98.6  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.95 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  32.12 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  32.12 
 
 		 205 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  32.12 
 
 		 186 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.56 
 
 		 189 aa  94.4  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.94 
 
 		 179 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.29 
 
 		 211 aa  93.6  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  31.93 
 
 		 207 aa  92.8  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 		 190 aa  92.4  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.93 
 
 		 188 aa  92.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  30.54 
 
 		 213 aa  92.4  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  30.91 
 
 		 177 aa  90.1  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.39 
 
 		 179 aa  90.5  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.52 
 
 		 178 aa  90.1  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  32.32 
 
 		 189 aa  87.8  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.72 
 
 		 178 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.12 
 
 		 178 aa  87  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  34.44 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.87 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  30 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.59 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.59 
 
 		 186 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  32.93 
 
 		 175 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  31.61 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  32.47 
 
 		 179 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1433  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  31.33 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.03 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.48 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  31.48 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.82 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  31.82 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  33.54 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  31.9 
 
 		 191 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.29 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.78 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  28.48 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  30.11 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3525  hypothetical protein  31.68 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  24.39 
 
 		 182 aa  75.9  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3064  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.45 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4592  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.06 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.991129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3419  hypothetical protein  29.45 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.94 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  34.42 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  30.06 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3355  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.7 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0563256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.06 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5135  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.14 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.94 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  30.86 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.66 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2759  hypothetical protein  27.74 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  30.82 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.67 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1714  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.59 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  30.06 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2115  hypothetical protein  29.81 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.433121  normal  0.170797 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5460  hypothetical protein  29.09 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5402  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.09 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092423 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.93 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  26.58 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.4 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  30.97 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>