142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1603 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 		 179 aa  365  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  82.68 
 
 		 179 aa  308  2.9999999999999997e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  49.72 
 
 		 179 aa  169  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  53.14 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.18 
 
 		 184 aa  158  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  50.84 
 
 		 179 aa  154  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.28 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  50.28 
 
 		 179 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  45.81 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.77 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  38.07 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  37.87 
 
 		 177 aa  114  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.22 
 
 		 184 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.28 
 
 		 178 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  34.46 
 
 		 181 aa  113  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  37.28 
 
 		 177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.22 
 
 		 182 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.8 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.71 
 
 		 178 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.57 
 
 		 184 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  37.29 
 
 		 183 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.08 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.8 
 
 		 181 aa  105  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  36.75 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.46 
 
 		 182 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  34.86 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  39.41 
 
 		 183 aa  104  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.72 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.63 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  35.39 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.26 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36 
 
 		 172 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  36 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  34.5 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  37.85 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  32.02 
 
 		 225 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  35.8 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.95 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1250  alkylhydroperoxidase  35.06 
 
 		 177 aa  95.1  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  38.12 
 
 		 180 aa  94.7  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.84 
 
 		 181 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  34.39 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  34.59 
 
 		 172 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.71 
 
 		 188 aa  88.6  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.33 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  33.9 
 
 		 192 aa  84.3  8e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.22 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  32.9 
 
 		 197 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.51 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.51 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  30.81 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  32.39 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  31.25 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  34.46 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  30.72 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  33.78 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  27.7 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  29.09 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  33.11 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.45 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  31.29 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  27.84 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  33.53 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  31.33 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  27.81 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.61 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.25 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  26.9 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.81 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  28.49 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  28.67 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  27.59 
 
 		 185 aa  66.6  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  29.07 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.17 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0485  hypothetical protein  29.68 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  25.75 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  27.52 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1446  hypothetical protein  31.07 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.885296  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0022  alkylhydroperoxidase  27.11 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.236735  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.86 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  25.29 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  24.86 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  29.2 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1745  hypothetical protein  26.45 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4244  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.17 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.502353  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  26.14 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1573  hypothetical protein  26.45 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0640101 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1859  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.61 
 
 		 176 aa  53.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0505741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  27.07 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4522  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.1 
 
 		 217 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.61443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1701  hypothetical protein  28.74 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0984593  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2465  hypothetical protein  27.11 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1888  hypothetical protein  30.36 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0113894  normal  0.523313 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5191  alkylhydroperoxidase AhpD core  35.48 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3669  uncharacterized peroxidase-related enzyme  31.01 
 
 		 216 aa  52  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237397 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  33.1 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  26.29 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1739  hypothetical protein  30.18 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0852288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  26.14 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>