156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0460 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0460  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 190 aa  382  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1537  alkylhydroperoxidase AhpD core  68.68 
 
 		 189 aa  244  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6510  alkylhydroperoxidase AhpD core  64.55 
 
 		 188 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.616705  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0103  alkylhydroperoxidase AhpD core  64.09 
 
 		 211 aa  229  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6744  alkylhydroperoxidase  64.02 
 
 		 207 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20217  normal  0.329225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2928  hypothetical protein  62.5 
 
 		 205 aa  229  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34460  hypothetical protein  61.96 
 
 		 186 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000949639  normal  0.16506 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5826  alkylhydroperoxidase  63.13 
 
 		 213 aa  218  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.835369  normal  0.917792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2273  alkylhydroperoxidase  58.7 
 
 		 208 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.707165  normal  0.323205 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6333  alkylhydroperoxidase  64.55 
 
 		 198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3639  alkylhydroperoxidase  58.33 
 
 		 219 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.438372 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2094  alkylhydroperoxidase  58.01 
 
 		 186 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0701  macrophage infectivity potentiator-related protein, putative  54.4 
 
 		 182 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000764627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12088  hypothetical protein  35.91 
 
 		 185 aa  134  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0745  hypothetical protein  35.91 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.680464  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1394  hypothetical protein  36.81 
 
 		 184 aa  127  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00257534  normal  0.766681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5163  carboxymuconolactone decarboxylase  34.39 
 
 		 191 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218763  normal  0.975035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02225  putative alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein MED92  34.07 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0320  carboxymuconolactone decarboxylase  36.32 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5712  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.84 
 
 		 197 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0850  alkylhydroperoxidase  32.04 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0269901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4052  hypothetical protein  33.7 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000149727  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0971  hypothetical protein  34.62 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838785 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1625  carboxymuconolactone decarboxylase  33.52 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3238  alkylhydroperoxidase  37.57 
 
 		 172 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114304  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1674  alkylhydroperoxidase AhpD family protein  29.38 
 
 		 181 aa  111  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3556  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.99 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1524  carboxymuconolactone decarboxylase  33.33 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2713  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.42 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.805371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2959  alkylhydroperoxidase  36.42 
 
 		 172 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0199901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2694  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.07 
 
 		 191 aa  103  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.481619 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0520  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.48 
 
 		 184 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1188  uncharacterized peroxidase-related enzyme  33.53 
 
 		 181 aa  100  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4595  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.49 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4328  alkylhydroperoxidase  35.56 
 
 		 184 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.646034  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3520  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.49 
 
 		 186 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.857138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3953  uncharacterized peroxidase-related enzyme  32.57 
 
 		 181 aa  98.6  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0799261 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0918  hypothetical protein  29.12 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.775247 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1548  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00182572  normal  0.0175445 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  36.99 
 
 		 172 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  32.96 
 
 		 189 aa  94.7  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4635  hypothetical protein  29.12 
 
 		 182 aa  93.6  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.382862 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2561  carboxymuconolactone decarboxylase  30.77 
 
 		 185 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.947792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5171  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.43 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8439  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  31.9 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.61 
 
 		 182 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  34.68 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6223  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.9 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.218919  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.33 
 
 		 178 aa  89.4  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3431  hypothetical protein  32.22 
 
 		 183 aa  85.1  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000244214 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3832  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.74 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.942836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5173  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.62 
 
 		 188 aa  83.2  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.448187 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8433  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  33.11 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  33.71 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2083  alkylhydroperoxidase  30.51 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3701  alkylhydroperoxidase (AhpD family core domain protein)  33.33 
 
 		 151 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.716433  normal  0.202413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  28.57 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3164  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.39 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5204  alkylhydroperoxidase  34.39 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0555876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0970  alkylhydroperoxidase  32.95 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5073  alkylhydroperoxidase  34.39 
 
 		 179 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3837  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 		 172 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.800288  normal  0.0356431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0515  alkylhydroperoxidase AhpD core  27.17 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.51071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.3 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5124  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  26.01 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7158  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.28 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6296  alkylhydroperoxidase  30.52 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.362919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3500  alkylhydroperoxidase  28.74 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0096  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.52 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  29.09 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3989  alkylhydroperoxidase  32.18 
 
 		 177 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00333801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2532  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.41 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6113  alkylhydroperoxidase AhpD core  28.67 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1899  hypothetical protein  27.96 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1603  alkylhydroperoxidase AhpD core  31.33 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2790  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.14 
 
 		 182 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.134722 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1956  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.62 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4242  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  23.57 
 
 		 184 aa  68.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.938374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1757  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.62 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0758  hypothetical protein  28.98 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00140607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3349  alkylhydroperoxidase  26.52 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.347693  normal  0.0410777 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0950  alkylhydroperoxidase AhpD  27.47 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2001  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.87 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.153933  normal  0.952873 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  27.11 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0452  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.500905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2396  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.87 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.692596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30.88 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0249  alkylhydroperoxidase AhpD core  24.24 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.331558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.12 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3407  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.23 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4675  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.47 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2668  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.27 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.71 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4745  uncharacterized peroxidase-related enzyme  25.41 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.969731 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7058  alkylhydroperoxidase-like protein  28.18 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.328149  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4271  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.12 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0429275  normal  0.148831 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.3 
 
 		 176 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5290  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.32 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.385188  normal  0.523649 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2199  hypothetical protein  27.85 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3003  hypothetical protein  27.22 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>