More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0895 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0895  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 
205 aa  423  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.371442  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1906  uncharacterized peroxidase-related enzyme  35.91 
 
 
180 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0226007  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  35.45 
 
 
159 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  35.45 
 
 
159 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.4 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1934  hypothetical protein  27.43 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000792468  normal  0.160018 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0971  hypothetical protein  27.81 
 
 
170 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000637227  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3940  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.2 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  33.62 
 
 
151 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  34.06 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3651  alkylhydroperoxidase  29.57 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486025  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  33.63 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  33.63 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3847  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.54 
 
 
184 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  33.63 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.41 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  32.41 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2768  VCBS  26.11 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.9777  hitchhiker  0.00424718 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.58 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2286  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.32 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  34.91 
 
 
167 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.7 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  33.94 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  30.7 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  33.94 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05232  4-carboxymuconolactone decarboxylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11590)  30.81 
 
 
234 aa  64.7  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0846359 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6700  uncharacterized peroxidase-related enzyme  28.11 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2547  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2403  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  31.78 
 
 
143 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2150  uncharacterized peroxidase-related enzyme  30.32 
 
 
178 aa  63.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0988  hypothetical protein  25.84 
 
 
186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.04 
 
 
152 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6203  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.85 
 
 
153 aa  63.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.164106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.27 
 
 
150 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2566  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  27.95 
 
 
182 aa  62  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.144004 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6812  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.69 
 
 
151 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3389  alkylhydroperoxidase  25.97 
 
 
189 aa  61.6  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.78 
 
 
145 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  33.33 
 
 
158 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  33.33 
 
 
159 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 
150 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 
150 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 
150 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 
150 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 
150 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  33.02 
 
 
150 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  34.78 
 
 
283 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  31.48 
 
 
147 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  32.11 
 
 
159 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  28.28 
 
 
145 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0488  Carboxymuconolactone decarboxylase  27.46 
 
 
197 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 
159 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.53 
 
 
151 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.98 
 
 
159 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4420  uncharacterized peroxidase-related enzyme  27.23 
 
 
181 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.286086  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  31.53 
 
 
145 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
145 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.03 
 
 
149 aa  59.3  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  33.04 
 
 
151 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  33.98 
 
 
145 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4730  putative alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  25 
 
 
225 aa  59.3  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.621118 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.19 
 
 
155 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  30.48 
 
 
159 aa  58.9  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  30.28 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  37.14 
 
 
157 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  31.07 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.95 
 
 
152 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  30 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
159 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  30 
 
 
159 aa  58.5  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  32.43 
 
 
156 aa  58.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  28.97 
 
 
144 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  28.97 
 
 
144 aa  58.5  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  34.48 
 
 
162 aa  58.5  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  30.63 
 
 
145 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  30.39 
 
 
147 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  32.38 
 
 
149 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  32.56 
 
 
146 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2646  alkylhydroperoxidase AhpD core  22.91 
 
 
176 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104106  normal  0.490574 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  30.63 
 
 
151 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  33.64 
 
 
157 aa  57.4  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.91 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  36.19 
 
 
157 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  29.91 
 
 
145 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  28.18 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2473  carboxymuconolactone decarboxylase  26.6 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227868  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3352  uncharacterized peroxidase-related enzyme  24.58 
 
 
176 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1245  Carboxymuconolactone decarboxylase  28.33 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  31.13 
 
 
151 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  29.36 
 
 
159 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0435  alkylhydroperoxidase  26.67 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  32.17 
 
 
151 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  29.91 
 
 
145 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  29.46 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  32.38 
 
 
149 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  27.59 
 
 
145 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>