296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3401 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
154 aa  313  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  66.88 
 
 
154 aa  215  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  58.27 
 
 
152 aa  180  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.67 
 
 
155 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  56.21 
 
 
155 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  55.17 
 
 
159 aa  164  4e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.24 
 
 
153 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  52.41 
 
 
157 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.3 
 
 
153 aa  158  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.52 
 
 
163 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  58.87 
 
 
157 aa  157  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
153 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  58.16 
 
 
157 aa  155  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  56.82 
 
 
145 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  56.74 
 
 
167 aa  153  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  48.28 
 
 
157 aa  153  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  47.59 
 
 
157 aa  153  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  50.99 
 
 
157 aa  153  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.75 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  49.66 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  57.04 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  53.79 
 
 
145 aa  150  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  50.74 
 
 
145 aa  150  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.11 
 
 
146 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  57.04 
 
 
158 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.68 
 
 
145 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
159 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.03 
 
 
163 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.61 
 
 
159 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.61 
 
 
159 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  51.63 
 
 
156 aa  148  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
153 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.34 
 
 
163 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  51.52 
 
 
145 aa  147  7e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.03 
 
 
145 aa  147  7e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  53.03 
 
 
149 aa  146  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  49.3 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.69 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  50.69 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.26 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
159 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.81 
 
 
156 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.53 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.86 
 
 
151 aa  144  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.31 
 
 
159 aa  144  5e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.27 
 
 
145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
159 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  47.92 
 
 
159 aa  143  9e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
159 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  57.04 
 
 
158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  48.28 
 
 
158 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.04 
 
 
158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  57.04 
 
 
158 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  51.35 
 
 
151 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.79 
 
 
145 aa  142  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  51.06 
 
 
145 aa  142  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  54.62 
 
 
143 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  51.77 
 
 
145 aa  141  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
145 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.95 
 
 
159 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  48.95 
 
 
159 aa  140  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  48.3 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.34 
 
 
158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.28 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  46.38 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  43.06 
 
 
145 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.14 
 
 
145 aa  135  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
159 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
159 aa  133  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.71 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.57 
 
 
152 aa  128  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  41.35 
 
 
147 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.77 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.67 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  48.59 
 
 
156 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.48 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  39.72 
 
 
147 aa  125  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.48 
 
 
152 aa  124  6e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  43.38 
 
 
159 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  49.21 
 
 
152 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  49.62 
 
 
150 aa  121  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.44 
 
 
159 aa  120  9e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0737  alkylhydroperoxidase  44.53 
 
 
144 aa  118  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.94 
 
 
151 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.28 
 
 
152 aa  117  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
150 aa  116  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  45.11 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.85 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.33 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.74 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>