262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2269 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
157 aa  321  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  97.45 
 
 
157 aa  315  2e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  68.79 
 
 
157 aa  228  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  54.55 
 
 
154 aa  178  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.28 
 
 
154 aa  153  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  54.33 
 
 
155 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  51.03 
 
 
159 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.36 
 
 
152 aa  147  7e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.28 
 
 
155 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  49.26 
 
 
145 aa  143  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.3 
 
 
153 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.18 
 
 
146 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.48 
 
 
146 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.59 
 
 
145 aa  141  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
163 aa  140  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.3 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.89 
 
 
163 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.53 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.06 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.36 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  47.92 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 
145 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.45 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.21 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  46.21 
 
 
149 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.53 
 
 
159 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
159 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
159 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.59 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  48.48 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  53.28 
 
 
158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  45.07 
 
 
145 aa  134  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.52 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.77 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  41.56 
 
 
153 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  45.14 
 
 
159 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.35 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.37 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.64 
 
 
151 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  47.73 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
159 aa  131  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  49.61 
 
 
159 aa  131  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.37 
 
 
159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  45.64 
 
 
151 aa  130  5e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.26 
 
 
153 aa  130  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.37 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.77 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.77 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
145 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
159 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.5 
 
 
159 aa  128  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  46.9 
 
 
162 aa  127  7.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.06 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.31 
 
 
143 aa  122  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
154 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.52 
 
 
157 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.29 
 
 
143 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.33 
 
 
151 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  48.03 
 
 
143 aa  120  9e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  44.68 
 
 
145 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.11 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  42.11 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  47.66 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  47.66 
 
 
149 aa  118  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  45.67 
 
 
145 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  47.66 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.66 
 
 
152 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  47.75 
 
 
157 aa  117  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  47.79 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  42.66 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  46.9 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  42.65 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3272  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  46.09 
 
 
149 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  52.68 
 
 
149 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.57 
 
 
155 aa  113  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  45.65 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.09 
 
 
149 aa  111  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 
147 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  48.67 
 
 
151 aa  112  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  46.09 
 
 
149 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  47.37 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  51.79 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.02 
 
 
156 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  47.37 
 
 
158 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
150 aa  110  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.9 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.56 
 
 
143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40.56 
 
 
144 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>