263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2370 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
146 aa  299  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.7 
 
 
146 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  52.82 
 
 
157 aa  162  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.35 
 
 
163 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.35 
 
 
163 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  49.67 
 
 
162 aa  154  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.72 
 
 
163 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  47.89 
 
 
145 aa  152  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.77 
 
 
145 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  48.61 
 
 
159 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.48 
 
 
148 aa  150  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
145 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.43 
 
 
145 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.95 
 
 
146 aa  147  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.35 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  55 
 
 
154 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.23 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  47.52 
 
 
158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  47.52 
 
 
145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.18 
 
 
145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.23 
 
 
145 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  48.23 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.1 
 
 
153 aa  143  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  48.23 
 
 
145 aa  143  9e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  47.52 
 
 
145 aa  142  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.52 
 
 
145 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.48 
 
 
152 aa  141  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.81 
 
 
145 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
145 aa  141  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
145 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.21 
 
 
152 aa  140  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.52 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.18 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  40.71 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
153 aa  136  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
163 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.23 
 
 
147 aa  136  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
167 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.7 
 
 
152 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.39 
 
 
155 aa  133  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.37 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.3 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 
157 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
154 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  41.84 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  41.13 
 
 
144 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  43.97 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  41.84 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
152 aa  130  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  43.38 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.86 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.88 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.66 
 
 
144 aa  128  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.96 
 
 
153 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  45.26 
 
 
144 aa  128  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  40.29 
 
 
159 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.56 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
163 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.96 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
159 aa  124  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.07 
 
 
159 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
159 aa  124  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.85 
 
 
151 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  46.09 
 
 
155 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
159 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  46.51 
 
 
157 aa  123  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
159 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  37.96 
 
 
147 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
159 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.85 
 
 
159 aa  122  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.12 
 
 
160 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  36.88 
 
 
150 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  41.5 
 
 
149 aa  121  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.58 
 
 
152 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.26 
 
 
150 aa  120  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
151 aa  120  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  48.09 
 
 
151 aa  120  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  45.93 
 
 
143 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
151 aa  119  9e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  35.77 
 
 
147 aa  120  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
151 aa  119  9e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 
159 aa  119  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  44.12 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.93 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.55 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.97 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.45 
 
 
129 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6288  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.16 
 
 
153 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00669161  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.01 
 
 
158 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  41.3 
 
 
154 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.44 
 
 
159 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3376  alkylhydroperoxidase  49.15 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0186  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.15 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>