245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1913 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1913  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
149 aa  303  4.0000000000000004e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2015  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  87.25 
 
 
149 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.419604  hitchhiker  0.00248557 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2448  alkylhydroperoxidase  87.25 
 
 
149 aa  270  6e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.19874  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2331  alkylhydroperoxidase  86.58 
 
 
149 aa  268  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.224128  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2331  alkylhydroperoxidase  85.23 
 
 
149 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  83.22 
 
 
149 aa  254  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  81.88 
 
 
149 aa  253  5e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  79.87 
 
 
149 aa  249  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  47.65 
 
 
162 aa  132  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  43.92 
 
 
159 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.15 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
154 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  50.39 
 
 
151 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.39 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.06 
 
 
146 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.14 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
145 aa  126  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.34 
 
 
155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.76 
 
 
163 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  47.55 
 
 
154 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.92 
 
 
159 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  45.27 
 
 
159 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.04 
 
 
145 aa  122  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  44.06 
 
 
145 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
163 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.01 
 
 
159 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.88 
 
 
145 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  46.32 
 
 
157 aa  121  4e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.36 
 
 
163 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.66 
 
 
145 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  42.66 
 
 
145 aa  120  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  41.89 
 
 
159 aa  120  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
145 aa  120  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3275  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.52 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.92 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  48.44 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  50.81 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.88 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  41.89 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  44.6 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.7 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  43.36 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  43.7 
 
 
149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  42.95 
 
 
159 aa  118  3e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.96 
 
 
145 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 
167 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  39.19 
 
 
157 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  46.72 
 
 
158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.36 
 
 
146 aa  117  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.59 
 
 
159 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
159 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  44.59 
 
 
159 aa  117  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.21 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  41.43 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  43.61 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.96 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0737  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213985  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  43.28 
 
 
145 aa  114  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 
158 aa  114  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.61 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  40.56 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  42.54 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  41.22 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.7 
 
 
153 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  46.09 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  41.79 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.54 
 
 
145 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  50.89 
 
 
167 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.89 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.22 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.22 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.38 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.73 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.07 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.07 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.15 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4101  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  40.54 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  39.31 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  40.54 
 
 
151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.17 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.85 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.12 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  48.12 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0020  alkylhydroperoxidase  48.12 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  50.93 
 
 
158 aa  111  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.45 
 
 
143 aa  110  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  40.91 
 
 
152 aa  110  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  40.54 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  41.26 
 
 
158 aa  110  8.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.54 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.06 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.67 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>