288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4265 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  100 
 
 
145 aa  299  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
145 aa  299  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  98.62 
 
 
145 aa  295  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  97.93 
 
 
145 aa  294  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  94.48 
 
 
145 aa  287  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  93.79 
 
 
145 aa  285  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  93.79 
 
 
145 aa  285  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  75 
 
 
145 aa  238  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  74.31 
 
 
145 aa  233  7e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  74.31 
 
 
145 aa  233  9e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  71.53 
 
 
145 aa  226  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  71.53 
 
 
145 aa  222  1e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  70.83 
 
 
145 aa  220  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  68.75 
 
 
145 aa  220  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  70.83 
 
 
149 aa  219  7e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  68.06 
 
 
145 aa  218  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  70.14 
 
 
145 aa  216  7e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  65.97 
 
 
145 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  60 
 
 
146 aa  189  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  57.34 
 
 
152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.47 
 
 
146 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  56.55 
 
 
162 aa  174  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.06 
 
 
153 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  52.82 
 
 
158 aa  164  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  51.39 
 
 
157 aa  164  5e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.48 
 
 
163 aa  163  9e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.48 
 
 
163 aa  162  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  49.65 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  55.94 
 
 
155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  54.01 
 
 
143 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.77 
 
 
163 aa  161  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  50.69 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  51.39 
 
 
145 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  51.05 
 
 
154 aa  159  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  48.97 
 
 
145 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  48.28 
 
 
145 aa  158  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.48 
 
 
155 aa  157  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  56.03 
 
 
155 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  48.61 
 
 
145 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  48.61 
 
 
159 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  48.61 
 
 
159 aa  153  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.23 
 
 
157 aa  149  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.39 
 
 
153 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.48 
 
 
153 aa  148  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
147 aa  147  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  42.86 
 
 
147 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
153 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  45.83 
 
 
159 aa  142  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
159 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.53 
 
 
159 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  46.53 
 
 
159 aa  141  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  46.81 
 
 
146 aa  141  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
159 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 
159 aa  137  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  47.89 
 
 
154 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.83 
 
 
159 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.65 
 
 
152 aa  137  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.92 
 
 
151 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.54 
 
 
163 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
159 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.2 
 
 
143 aa  136  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.44 
 
 
154 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  45.32 
 
 
144 aa  135  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  45.32 
 
 
144 aa  135  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
143 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  43.15 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  47.14 
 
 
167 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
159 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  42.36 
 
 
150 aa  134  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  46.43 
 
 
157 aa  134  5e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  47.22 
 
 
151 aa  134  5e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  47.14 
 
 
157 aa  133  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
151 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.44 
 
 
152 aa  133  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  46.48 
 
 
157 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45 
 
 
155 aa  132  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.15 
 
 
151 aa  133  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
157 aa  133  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.81 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.36 
 
 
159 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.95 
 
 
146 aa  131  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  42.25 
 
 
150 aa  131  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  40.97 
 
 
159 aa  131  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  46.85 
 
 
149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
151 aa  130  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  45.65 
 
 
167 aa  130  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.43 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 
158 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.97 
 
 
159 aa  130  6.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
157 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.04 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  45.39 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
156 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  47.52 
 
 
152 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  45.45 
 
 
149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  38.36 
 
 
151 aa  127  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>