More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3720 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
143 aa  296  8e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  62.68 
 
 
143 aa  183  8e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  62.68 
 
 
143 aa  182  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  61.87 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  62.68 
 
 
144 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  62.68 
 
 
144 aa  179  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  62.68 
 
 
144 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  62.68 
 
 
144 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  62.68 
 
 
144 aa  178  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  59.71 
 
 
143 aa  176  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  56.12 
 
 
144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  56.12 
 
 
144 aa  163  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
151 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
151 aa  144  5e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
150 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
150 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
150 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
150 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
150 aa  143  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  49.64 
 
 
150 aa  143  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.2 
 
 
155 aa  139  9e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  47.52 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.55 
 
 
283 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.66 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
149 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
145 aa  135  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.07 
 
 
151 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.37 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 
145 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.47 
 
 
145 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.85 
 
 
145 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  44.37 
 
 
145 aa  133  9e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.66 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.83 
 
 
152 aa  132  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.76 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.55 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  41.55 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
145 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.25 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.25 
 
 
145 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.8 
 
 
159 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  43.8 
 
 
159 aa  130  5e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.85 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  41.55 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.37 
 
 
146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  43.57 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  40.85 
 
 
145 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 
153 aa  128  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.48 
 
 
149 aa  128  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 
152 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  48.23 
 
 
155 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.03 
 
 
145 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  39.44 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.13 
 
 
153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.83 
 
 
155 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.86 
 
 
153 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.88 
 
 
159 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
155 aa  124  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.72 
 
 
153 aa  123  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  48.82 
 
 
157 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  41.96 
 
 
162 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 
159 aa  122  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.43 
 
 
163 aa  121  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  40.43 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  40.43 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.3 
 
 
163 aa  120  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40.15 
 
 
145 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0025  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.26 
 
 
153 aa  120  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0126747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.01 
 
 
146 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  39.42 
 
 
145 aa  120  7e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  48.03 
 
 
157 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.72 
 
 
163 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  45.67 
 
 
157 aa  119  9e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.73 
 
 
159 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  37.32 
 
 
157 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.17 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.13 
 
 
159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  39.01 
 
 
159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.01 
 
 
159 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.01 
 
 
159 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  39.01 
 
 
159 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.43 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  39.72 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.13 
 
 
157 aa  116  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  40.43 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  40.85 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  40.85 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  41.35 
 
 
167 aa  114  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  37.59 
 
 
159 aa  114  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.86 
 
 
157 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.85 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.58 
 
 
159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.43 
 
 
153 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>