289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1084 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  69.06 
 
 
145 aa  206  8e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  67.63 
 
 
145 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  64.79 
 
 
145 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  64.08 
 
 
145 aa  190  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.2 
 
 
145 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  59.12 
 
 
145 aa  170  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  58.39 
 
 
149 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  58.39 
 
 
145 aa  168  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  56.93 
 
 
145 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  57.66 
 
 
145 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  55.8 
 
 
162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  56.2 
 
 
145 aa  164  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  56.93 
 
 
145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  55.47 
 
 
145 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  53.28 
 
 
145 aa  163  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.01 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  54.01 
 
 
153 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  54.01 
 
 
145 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  54.01 
 
 
145 aa  161  3e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.28 
 
 
145 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  51.82 
 
 
145 aa  159  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  51.82 
 
 
145 aa  158  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.45 
 
 
153 aa  158  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  53.28 
 
 
152 aa  157  5e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.09 
 
 
146 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.09 
 
 
146 aa  153  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.82 
 
 
145 aa  152  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.09 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  54.01 
 
 
157 aa  150  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.91 
 
 
153 aa  150  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.47 
 
 
145 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.91 
 
 
153 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  53.33 
 
 
154 aa  148  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  53.24 
 
 
155 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  48.91 
 
 
154 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.62 
 
 
154 aa  141  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.86 
 
 
155 aa  140  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.52 
 
 
155 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  50.36 
 
 
159 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  46.04 
 
 
159 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  46.04 
 
 
159 aa  140  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.06 
 
 
159 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  47.06 
 
 
159 aa  140  6e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.18 
 
 
163 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.26 
 
 
149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.45 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.83 
 
 
152 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  51.11 
 
 
150 aa  137  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.45 
 
 
163 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.45 
 
 
153 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.97 
 
 
151 aa  136  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  51.11 
 
 
152 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.43 
 
 
152 aa  134  5e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.18 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.18 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.18 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.18 
 
 
150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  45.65 
 
 
158 aa  133  7.000000000000001e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  45.65 
 
 
167 aa  133  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.18 
 
 
150 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.45 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.26 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 
158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.63 
 
 
163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  43.07 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.26 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  48.18 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.48 
 
 
143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  42.03 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  42.03 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  42.03 
 
 
144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
159 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.55 
 
 
155 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.75 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.8 
 
 
159 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.8 
 
 
159 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.72 
 
 
283 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  42.75 
 
 
144 aa  126  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.26 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  45.26 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.3 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  44.53 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.67 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  45.26 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.53 
 
 
159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.3 
 
 
144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.34 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  46.88 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.07 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.99 
 
 
159 aa  124  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  46.04 
 
 
157 aa  125  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.88 
 
 
146 aa  124  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 
159 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  46.76 
 
 
167 aa  123  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.92 
 
 
165 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.92 
 
 
165 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  45.31 
 
 
157 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>