More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5162 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
155 aa  320  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.16 
 
 
152 aa  201  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  62.67 
 
 
152 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  54.67 
 
 
167 aa  166  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0996  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.55 
 
 
283 aa  161  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.353647  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1900  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.15 
 
 
150 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1369  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.15 
 
 
150 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1057  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.15 
 
 
150 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1219  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.15 
 
 
150 aa  157  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0811  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  53.15 
 
 
150 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1211  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  52.45 
 
 
150 aa  156  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.501081  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0022  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
145 aa  150  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0027  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.33 
 
 
157 aa  149  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.456012 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  48.55 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.64 
 
 
149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  48.95 
 
 
145 aa  144  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.86 
 
 
146 aa  142  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.59 
 
 
143 aa  141  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  47.95 
 
 
149 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  47.86 
 
 
143 aa  140  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3666  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.89 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.315709  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  48.2 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  48.59 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  47.55 
 
 
145 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.89 
 
 
145 aa  138  3e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.14 
 
 
163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.89 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 
145 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 
162 aa  135  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.18 
 
 
145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1594  alkylhydroperoxidase  45.32 
 
 
144 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.76 
 
 
155 aa  134  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1807  alkylhydroperoxidase  45.32 
 
 
144 aa  134  5e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 
145 aa  133  8e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  45.71 
 
 
145 aa  133  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  46.98 
 
 
154 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.18 
 
 
145 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  45 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.71 
 
 
153 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  44.6 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6098  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.73 
 
 
153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  42.66 
 
 
143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  45 
 
 
145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.83 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.37 
 
 
153 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.14 
 
 
163 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  41.96 
 
 
143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.17 
 
 
145 aa  130  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  45.99 
 
 
154 aa  130  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  44.3 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.88 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  45.77 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.66 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  50.68 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  41.84 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  44.6 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.67 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  44.29 
 
 
145 aa  128  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
151 aa  128  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2951  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.26 
 
 
144 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0696867  normal  0.0134978 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3003  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.26 
 
 
144 aa  128  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0047955 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2920  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  41.26 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.789877  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2986  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.26 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3109  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain-containing protein  41.26 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280387  normal  0.494752 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.97 
 
 
159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.55 
 
 
159 aa  125  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  43.26 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.37 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  45.58 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.48 
 
 
154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  43.66 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  41.78 
 
 
159 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.96 
 
 
145 aa  125  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  47.89 
 
 
157 aa  124  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.43 
 
 
159 aa  123  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.14 
 
 
151 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.88 
 
 
157 aa  123  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1333  alkylhydroperoxidase  42 
 
 
151 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.59317 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 
159 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.13 
 
 
159 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 
159 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.72 
 
 
146 aa  120  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.54 
 
 
150 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3949  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
152 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 
149 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
151 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  45.07 
 
 
157 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  39.72 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  40.67 
 
 
167 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  40.94 
 
 
149 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.39 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>