264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2179 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  100 
 
 
146 aa  304  3e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  58.16 
 
 
144 aa  183  8e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  54.23 
 
 
159 aa  169  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.43 
 
 
150 aa  153  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  49.32 
 
 
150 aa  152  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  48.63 
 
 
162 aa  151  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  50.68 
 
 
152 aa  148  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  51.08 
 
 
147 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.59 
 
 
153 aa  144  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.52 
 
 
145 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  45.52 
 
 
149 aa  142  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  46.48 
 
 
144 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  50.36 
 
 
147 aa  141  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.83 
 
 
145 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.45 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
145 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  43.26 
 
 
146 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.32 
 
 
163 aa  134  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 
163 aa  133  9e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.32 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.83 
 
 
145 aa  131  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.95 
 
 
145 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  47.95 
 
 
145 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
157 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
145 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  47.95 
 
 
145 aa  130  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
150 aa  130  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  44.44 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  43.75 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  43.75 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.76 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.21 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  44.14 
 
 
145 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  46.15 
 
 
155 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.45 
 
 
155 aa  127  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  45.07 
 
 
154 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
145 aa  126  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.1 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  41.67 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.17 
 
 
158 aa  124  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  43.45 
 
 
159 aa  125  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.66 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.66 
 
 
150 aa  124  5e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
145 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  43.88 
 
 
143 aa  124  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3546  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
147 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225278  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.24 
 
 
146 aa  124  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  42.36 
 
 
153 aa  123  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  43.57 
 
 
158 aa  123  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
155 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  54.37 
 
 
129 aa  122  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.45 
 
 
153 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
145 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  44.78 
 
 
152 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.45 
 
 
153 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
159 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40 
 
 
147 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.82 
 
 
159 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  40.82 
 
 
159 aa  120  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.31 
 
 
145 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  42.47 
 
 
163 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  42.55 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.5 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
157 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
152 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.13 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.46 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.86 
 
 
152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  39.16 
 
 
151 aa  114  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.78 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  42.45 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  42.86 
 
 
154 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.78 
 
 
159 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.56 
 
 
158 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  40.14 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  42.96 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  41.38 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4693  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 
149 aa  111  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.93 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.79 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0272  alkylhydroperoxidase  40.88 
 
 
150 aa  110  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4152  alkylhydroperoxidase AhpD core  55.17 
 
 
90 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0101808  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  39.46 
 
 
159 aa  110  7.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  44.44 
 
 
157 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0996  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.97 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.710241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  41.13 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  39.46 
 
 
159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000236  4-carboxymuconolactone decarboxylase domain/alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  40 
 
 
153 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.5 
 
 
152 aa  107  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2464  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
151 aa  107  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.73 
 
 
159 aa  107  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.55 
 
 
159 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  39.33 
 
 
159 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.89 
 
 
150 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.93 
 
 
152 aa  105  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.57 
 
 
153 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  45.65 
 
 
156 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  45.65 
 
 
156 aa  105  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>