More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0029 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0029  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
144 aa  293  7e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622456  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2179  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  58.16 
 
 
146 aa  183  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3734  alkylhydroperoxidase  55.94 
 
 
150 aa  166  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51777  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1943  hypothetical protein  50.7 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.278152  normal  0.0324993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3098  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  54.41 
 
 
150 aa  157  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000850498  normal  0.853623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  48.92 
 
 
150 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
147 aa  143  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3241  hypothetical protein  47.55 
 
 
144 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.371033  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  46.1 
 
 
147 aa  140  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50.36 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  46.04 
 
 
149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.2 
 
 
152 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  51.08 
 
 
145 aa  137  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.04 
 
 
145 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.63 
 
 
153 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.04 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  45.32 
 
 
145 aa  136  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  46.94 
 
 
154 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.6 
 
 
163 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.15 
 
 
146 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  46.04 
 
 
157 aa  130  6e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.93 
 
 
163 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  44.83 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.88 
 
 
146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  43.88 
 
 
162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  45.26 
 
 
146 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1182  alkylhydroperoxidase  46.32 
 
 
163 aa  128  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3210  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.07 
 
 
147 aa  126  8.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00706946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  42.03 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1660  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.45 
 
 
160 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  46.76 
 
 
158 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.45 
 
 
145 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5624  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 
167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.522568 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 
154 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 
145 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  47.76 
 
 
152 aa  123  7e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2847  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.27 
 
 
158 aa  123  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150118  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  41.5 
 
 
145 aa  123  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.73 
 
 
145 aa  123  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3822  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
152 aa  122  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176848  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.53 
 
 
145 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.3 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 
145 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  41.84 
 
 
143 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.62 
 
 
155 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8901  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.32 
 
 
163 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.93 
 
 
151 aa  122  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  40.82 
 
 
145 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  40.58 
 
 
145 aa  120  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  46.21 
 
 
155 aa  120  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.01 
 
 
145 aa  120  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.75 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  42.75 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  43.17 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6705  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.96 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.625581  normal  0.389522 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.06 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  44.2 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  46.48 
 
 
157 aa  118  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1128  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.25 
 
 
148 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.453208 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5378  alkylhydroperoxidase  49.26 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28383  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  42.14 
 
 
159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4997  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.26 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.56474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5085  alkylhydroperoxidase  49.26 
 
 
156 aa  117  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  44.85 
 
 
151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1402  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.91 
 
 
146 aa  116  7.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  41.3 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  43.75 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5805  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
152 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0418506  normal  0.111709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  43.07 
 
 
159 aa  115  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3546  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.28 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.225278  normal  0.0570392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2877  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.22 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.75 
 
 
155 aa  114  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.84 
 
 
154 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6384  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.39128  normal  0.0625105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6087  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.782887  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2565  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.43 
 
 
129 aa  111  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.929389  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.96 
 
 
159 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  49.12 
 
 
167 aa  110  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  43.18 
 
 
156 aa  110  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6989  alkylhydroperoxidase  38.57 
 
 
151 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.793098  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  39.86 
 
 
145 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1903  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.14 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  38.85 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3554  alkylhydroperoxidase  37.86 
 
 
151 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.249618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0021  alkylhydroperoxidase  47.01 
 
 
157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4008  hypothetical protein  44.96 
 
 
156 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2623  alkylhydroperoxidase  43.28 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6133  alkylhydroperoxidase AhpD core  37.86 
 
 
151 aa  108  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  39.86 
 
 
153 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  36.23 
 
 
159 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  35.56 
 
 
159 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  37.04 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3205  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.15 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.019288  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0103  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.28 
 
 
157 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.335572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0050  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.31 
 
 
158 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.464213  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  36.3 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0039  alkylhydroperoxidase  48.31 
 
 
158 aa  105  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>